Gz-gamma. Schätzung der erwarteten Anzahl von Substitutionen an jeder Aminosäurereite
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Gz-gamma. Ranking & Zusammenfassung

Gz-gamma. Stichworte

Reihenfolge Einschätzung Säure DNA-Sequenz Zeitschätzung Säuretitration. Dna. saure Schriftart Disparitätsschätzung Säurertransaktion. FDR-Schätzung. Aminosäure finden. Aminosäurefinder Suche nach Aminosäure Aminosäureanalysator. Aminosäuresequenz. Aminosäure Aminosäure-Übersetzer Aminosäure extrahieren Leistungsschätzung. Osmoseschätzung. Säurelösung Aminosäurerest optimale Aminosäure Aminosäure analysieren Nukleinsäure ZAHLEN SIE SUBSTITUTIONS NUMMER. Analysieren Sie das Aminosäurepaar Aminosäuren-Paaranalyse Große Phylogeneschätzung Aminosäure-Sequenzanalyse Aminosäuresequenz analysieren Aminosäureklassifizierung. Aminosäure-Topologie Aminoacid-Analyse. Phylogenetische Beziehung Aminosäure Aminosäure-Detektor Aminosäure erkennen Bemühungsschätzung Aminosäurekette analysieren Säureschlaufen erwartet erwartete Rückkehr ACID pro ACID Pro 7

Gz-gamma. Beschreibung

Gz-Gamma wurde entwickelt, um die erwartete Anzahl von Substitutionen jedes Aminosäure-Standorts (Nukleotid) und den Gamma-Formparameter für die Ratenvariante zwischen den Standorten unter Verwendung einer Kombination aus Ahnensequenz-Inferenz und maximaler Wahrscheinlichkeitsschätzung bei den phylogenetischen Beziehungen dieser Homologe Sequenzen sind bekannt. Dieses Paket enthält zwei Programme: gz-aa.exe für Aminosäuresequenzen und gz-dna.exe für DNA-Sequenzen, die in C-Sprache codiert sind. Um das Programm zu nutzen, benötigen Sie eine Eingabedatei, die die Aminosäure- (oder Nukleotid-) Sequenzen und die Tree-Topologie dieser Sequenzen enthält (siehe ATP6.AA für ein Beispiel). Diese Datei beginnt mit zwei Zahlen: die Anzahl der Sequenzen und die Anzahl der Aminosäure- oder Nukleotidstellen (Sequenzlänge). Die zweite Zeile ist der Name der ersten Sequenz, und die dritte Zeile ist die erste Reihenfolge und so weiter. Jede Sequenz sollte eine Linie ohne Unterbrechung einnehmen. In den Sequenzen sind nur die Buchstaben (aktiviert) für die 20 Aminosäuren (oder 4 Nukleotide) zulässig. Die Lücken oder andere Symbole sollten bereits entfernt worden sein. Die letzte Zeile der Datei ist die Tree-Topologie der Sequenzen. Das Baumformat ist das gleiche wie der in Phylip-Paket verwendete. HINWEIS

Gz-gamma. Zugehörige Software