Cbcanalyzer. Infektion von Phyogenien basierend auf kompensatorischen Basisänderungen (CBCs)
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Cbcanalyzer. Ranking & Zusammenfassung

Cbcanalyzer. Stichworte

Phyogenien simulieren Phylogenies-Simulation. große Phygenien schätzen. Große Phygeniesschätzung. große Phylogenies-Analyse. Ausgleichsbasisänderung. CT-Transformation CBC-Erkennung. CTTransform CBCDetect CBCTree

Cbcanalyzer. Beschreibung

Der CBCANALYZER (CBC = Kompensationsbasisänderung) wurde entwickelt, um eine benutzerdefinierte schriftliche Software-Toolbox zu sein, die aus drei Teilen, CTTransform, CBCDETECT und CBCTREE besteht. CTTRansform liest mehrere CT-Dateiformate (CT, RNAVIZ CT oder MAC CT) und erzeugt ein so genanntes "Bracket-Dot-Brackets" -Format, das typischerweise als Eingabe für andere Werkzeuge wie RNAFORESTER, RNNAMOVIE oder MARNA verwendet wird. Letzteres erstellt eine mehrfache Ausrichtung basierend auf Primärsequenzen und Sekundärstrukturen, die jetzt als Eingabe für CBCDETECT verwendet werden können. Hiermit zählen wir für CBCs in allen gegen alle ausgerichteten Sequenzen, was bei der Erkennung von Arten wichtig ist, diskriminiert auf ihre sexuelle Inkompatibilität. Die durch CBCDETECT erhaltene Zählung (Entfernung) -Matrix wird als Eingabe für CBCTREE verwendet, der ein Phylogramm mithilfe des Algorithmus von BIONJ.Nicht rekonstruiert: Cbcanalyzer ist für den nicht kommerziellen Gebrauch frei verfügbar

Cbcanalyzer. Zugehörige Software