SSA ein Programm zum Inferrieren der maximalen Wahrscheinlichkeit von Phyogenien aus DNA-Sequenzen
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SSA Ranking & Zusammenfassung

SSA Stichworte

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SSA Beschreibung

SSA wurde entwickelt, um ein Programm zur Inferrierung der maximalen Wahrscheinlichkeit von Phylogenies aus DNA-Sequenzen zu sein. Es stehen zwei Versionen des Programms zur Verfügung: einer, das eine molekulare Uhr und eine annimmt, die diese Annahme nicht trifft. Das Verfahren zum Suchen des Raums von Bäumen für den ML-Baum basiert auf einem Algorithmus des simulierten Glühs und ist in der obigen Referenz beschrieben. Das Programm implementiert das F84-Modell von Felsenstein von Nukleotidersubstitution und zugehörigen Untermodellen. Das Programm schätzt den ML-Baum- und Zweiglängen und kann optional das Transversions- / Transversion-Verhältnis schätzen. Bei der Kündigung gibt das Programm die Käfern der höchsten Wahrscheinlichkeit während der Suche zurück, wobei k vom Benutzer festgelegt werden kann.

SSA Zugehörige Software