Vorfahr Inferenz der Ahnen-Aminosäuresequenzen durch die distanzbasierte Bayeser-Methode
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Vorfahr Ranking & Zusammenfassung

Vorfahr Stichworte

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Vorfahr Beschreibung

Die Anwendungsanwendung wurde auf Ahnen-Aminosäuresequenzen aus einem Satz homologer Aminosäuresequenzen abgerechnet, deren phylogenetische Beziehungen bekannt sind. Dieses Paket enthält ein Programm: acestor.exe, der in c-Sprache verfasst ist. Um das Programm zu verwenden, benötigen Sie eine Eingabedatei, die die Aminosäuresequenzen und die Tree-Topologie dieser Sequenzen enthält (siehe LYSOZYME.AA für ein Beispiel). Diese Datei beginnt mit zwei Zahlen: Die Anzahl der Sequenzen und die Anzahl der Aminosäure-Sites (Sequenzlänge). Die zweite Zeile ist der Name der ersten Sequenz, und die dritte Zeile ist die erste Reihenfolge und so weiter. Nur der ein Buchstabencode (aktiviert) für die 20 Aminosäuren ist in den Sequenzen erlaubt. Die Sequenzen sollten ausgerichtet sein und Lücken oder andere Symbole bereits entfernt werden. Die letzte Zeile der Datei ist die Tree-Topologie der Sequenzen. Das Baumformat ist derselbe wie das in Phylip-Paket (Felsenstein 1995). HINWEIS

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