Semphie

ein Werkzeug zur datenintensiven phylogenetischen Rekonstruktion
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Semphie Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Lizenz:
  • Freeware
  • Name des Herausgebers:
  • Tal Pupko
  • Betriebssysteme:
  • Windows All
  • Dateigröße:
  • 512 KB

Semphie Stichworte


Semphie Beschreibung

Als Insblatt wurde ein Werkzeug für die datenintensive phylogenetische Rekonstruktion entwickelt. Semphie schließt Phylogenies durch maximale Wahrscheinlichkeit, das etablierte Kriterium für das Festfinden des richtigen phylogenetischen Baums. Semphy sucht nach der wahrscheinlichsten Topologie des Evolutionsbaums und den optimalen Längen seiner Zweige. Es verwendet das algorithmische Paradigma des strukturellen EM in einer neuen Rechenmethode für phylogenetische Inferenz, wobei die Berechnung sowohl effektiv als auch effizient erstellt wird: SMPHY kann sehr große Datensätze mit guter Genauigkeit und angemessener Laufzeit umgehen. Wir beziehen sich auf das EM-Verfahren als "Semphy Step". Alle Verwendungen von SMPhy sollen die ausführbare Halbmänge von einer Eingabeaufforderung mit einigen Parametern anrufen: Semphie


Semphie Zugehörige Software

Fastml

ein Programm zum Berechnen der Ahnen-Aminosäuresequenzen eines phylogenetischen Baums ...

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