Hon-new. ein Verfahren zum Berechnen konservativer und radikaler nichtsonnenermischer Entfernungen
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Hon-new. Ranking & Zusammenfassung

Hon-new. Stichworte

Reihenfolge DNA-Sequenz Dna. radikaler Zusammenbruch radikaler Effekt Radikale Entfernungen Aminosäure Entfernungen Tracker. Rate von Nonsynonym patristische Entfernungen finden. nicht-synonyme Entfernung Aminosäureklassifizierung. radikale Nichtsonnenniefische Entfernung Nichtsnoundonyme Substitution. radikaler Lernender Entfernungen umrechnen Kartierung von Entfernungen.

Hon-new. Beschreibung

Die hon-neue Anwendung wurde für die Schätzung konservativer und radikaler nichtsonneneronymer Abstände zwischen den DNA-Sequenzen der Proteinkodierung konzipiert. Die Methode wird von der ursprünglichen Methode von Hughes, OTA und NEI (1990), indem sie die Übergangsvorspannung berücksichtigt. Es werden drei Arten von Aminosäureklassifizierungen (Ladung, Polarität und der von Miyata und Yasunaga) bereitgestellt. Man kann auch konservative und radikale Aminosäurewechsel von sich selbst definieren. Man kann Aminosäuregruppen definieren, damit sich radikale Änderungen zwischen Gruppen radikal sind und in Gruppen konservativ sind. Erstellen Sie dazu eine Datei namens self.div. In dieser Datei sollte die erste Zeile die Gruppen von Aminosäuren sein (z. B. im Fall von Ladung, es gibt drei Gruppen ), die zweite Zeile ist die Anzahl der Aminosäuren in der ersten Gruppe, ein Raum und die Aminosäuren in der Gruppe. Ein Buchstabencode von Aminosäuren sollte verwendet werden. Die nächste Zeile ist die Informationen für die zweite Gruppe. Man muss nur die Informationen der ersten N-1-Gruppen eingeben, wenn insgesamt N-Gruppen vorhanden sind, da die letzte Gruppe aus den Informationen der ersten N-1-Gruppen abgeleitet werden kann.

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