Flexibel Vorhersage von Liganden-Superpositionen auf Ihrem PC.
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Flexibel Ranking & Zusammenfassung

Flexibel Stichworte

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Flexibel Beschreibung

Flexs prognostiziert die Konformation und Orientierung eines der Liganden relativ zu dem anderen. In Flexen wird der Referenzligand angenommen, dass es starr ist, somit sollte es in einer Konformation gegeben werden, die dem gebundenen Zustand ähnlich ist. Der Überlagerungsalgorithmus in Flexs erfordert nur wenig manuelle Eingriffe. Sie können dieses Wissen in die Berechnungen mit Flex-Integration integrieren, indem Sie einzelne Schritte manuell ausführen. Somit ist Flexs für interaktive Arbeiten an Ligandenpaaren sowie für ein virtuelles ligandbasiertes virtuelles Screening entwickelt. Die beiden Hauptanwendungen von Flexs sind Liganden-Superpositionierung (z. B. für COMFA / QSAR) und virtuelles Screening. Wenn Sie ein Protein und ein kleines Molekül-Bindung daran haben (sogenannter Referenzligand), aber keine Struktur des Proteins, können Sie die Referenzstruktur als negativer Fingerabdruck der aktiven Stelle annehmen. Flexs bestimmt die Ähnlichkeit zwischen dem Test und der Referenzstruktur, indem sie sie ausrichten. Im virtuellen Screening haben Sie einen Referenzligand und einen Satz von Verbindungen und Sie sind daran interessiert, die Verbindungen für experimentelle Prüfungen zu priorisieren.

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