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Eine einverstümliche multi-dimensionale Umgebung für die Echtzeitdatenanalyse und die Entscheidungsfindung. ...
 | Macs2.Modellbasierte Analyse für Chip-SEQ-Daten |
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Macs2. Ranking & Zusammenfassung
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- Lizenz:
- Artistic License
- Preis:
- FREE
- Name des Herausgebers:
- Tao Liu
- Website des Verlags:
- http://github.com/taoliu/
Macs2. Stichworte
Macs2. Beschreibung
Macs2 ist ein modellbasiertes Analysewerkzeug für Chip-SEQ-Daten. Mit der Verbesserung der Sequenzierungstechniken, der Chromatin-Immunpräzipitation, gefolgt von einer hohen Durchsatzsequenzierung (Chip-SEQ), wird beliebt, um genom-weite Protein-DNA-Wechselwirkungen zu studieren. Um das Fehlen einer leistungsstarken Chip-SEQ-Analysemethode anzusprechen, präsentieren wir einen neuen Algorithmus, der als modellbasierte Analyse von Chip-SEQ (Macs), um Transkriptionsfaktor-Bindungsstellen zu identifizieren. Macs erfasst den Einfluss der Genomkomplexität, um die Bedeutung angereicherter Chipregionen zu bewerten, und Macs verbessert die räumliche Auflösung von Bindungsstellen durch Kombination der Informationen sowohl der Angaben sowohl der Sequenzierungs-Tag-Position als auch der Orientierung. Macs können einfach für Chip-SEQ-Daten allein oder mit Steuerprobe mit der Erhöhung der Spezifitäts-Homepage verwendet werden.
Macs2. Zugehörige Software
Mohn
Physikalische Optikausbreitung (Wellenfrontbeugung) für optische Simulationen, insbesondere von Teleskopen. ...
