Triplikat ein Programm, um Konsensbäume von verwurzelten Triples zu erstellen
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Triplikat Ranking & Zusammenfassung

Triplikat Stichworte

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Triplikat Beschreibung

Triplec wurde entwickelt, um ein Programm zu sein, um Konsensbäume von verwurzelten Tripeln zu erstellen. Verwendung JAVA -JAR TRIPLEC.JAR NOREPS INFILE.NEWICK Hier ist Noreps die Anzahl der dreifachen Rekonstruktionen für den Konsens. Dies ist erforderlich, da der Rekonstruktion ein randomisierter Algorithmus ist. Für kleine Bäume von etwa 20 TAXA 1000-Replikaten reicht aus. Für größere Datensätze sollten jedoch größere Zahlen verwendet werden. Infin.newick ist eine Textdatei mit einem Newick Tree pro Zeile. Die Bäume gelten als verwurzelt und jeder Baum muss nur die Taxa-Etiketten des ersten Baums enthalten. Das ist Bäume, nachdem das erste keine neue Taxa enthalten darf. Obwohl es kein Fehler ist, um Bäume mit weniger Taxa als den ersten Baum als Teil des Konsens zu haben, ist diese Methode keine Superbaummethode. Die Leistung unter diesen Bedingungen wurde nicht getestet und wir erwarten, dass wir schlecht funktionieren.

Triplikat Zugehörige Software