Tarzan

Berechnen Sie alle günstigsten Rekonstruktion
Jetzt downloaden

Tarzan Ranking & Zusammenfassung

Anzeige

  • Rating:
  • Lizenz:
  • Freeware
  • Name des Herausgebers:
  • Parallel Computing and Complex Systems
  • Betriebssysteme:
  • Windows All
  • Dateigröße:
  • 133 KB

Tarzan Stichworte


Tarzan Beschreibung

Die Tarzan-Anwendung verwendet eine ereignisbasierte Methode, mit der Benutzer Kosten minimal oder Rekonstruktionen oder Rekonstruktionen mit einer minimalen (oder maximalen) Anzahl bestimmter evolutionärer Ereignisse aufweisen können. Fünf verschiedene Arten von evolutionären Ereignissen werden berücksichtigt: Cospeication, Vervielfältigung, Sortierung, Umschaltung und Aussterben. Für Host-Parasiten-Systeme CoPecations-Ereignisse finden Sie in der Simultan-Host- und Parasitenspezialisierung. Duplizierungsereignisse sind unabhängige Parasitenspezifikationen, Sortierereignisse entsprechen der Lineationssortierung, und Switches entsprechen den Hostverschiebungen. Haupteigenschaften: Tarzan bietet nicht nur die Möglichkeit, einen günstigsten Wiederaufbau zu berechnen, sondern auch die Rekonstruktion berechnen kann, die in anderen Kriterien berechnet wird. Darüber hinaus kann eine Hierarchie von Kriterien definiert werden (in diesem Fall erfolgt die Optimierung zunächst in Bezug auf das wichtigste Kriterium, dann erfolgt in allen gefundenen optimalen Lösungsoptimierung in Bezug auf das zweithöchste Kriterium und so weiter. Mögliche Kriterien sind (in Jedem Fall ist das Minimum oder ein Maximum möglich): Kosten, Anzahl der Colokationen, Anzahl der Duplikationen, Anzahl der Sortierungen, Anzahl der Hostschalter, Anzahl der Erweiterungen Die maximale Anzahl der günstigsten Rekonstruktionen, die von Tarzan berechnet werden, können vom Benutzer festgelegt werden. Tarzan kann auch alle möglichen Rekonstruktionen auflisten, die für Fälle interessant sein könnten, in denen nicht zu viele Rekonstruktionen vorhanden sind.


Tarzan Zugehörige Software

SSA

ein Programm zum Inferrieren der maximalen Wahrscheinlichkeit von Phyogenien aus DNA-Sequenzen ...

483 368 KB

Herunterladen