Simdiv

Erstellen von Datensätzen unter einer Isolation mit Migrationsmodell
Jetzt downloaden

Simdiv Ranking & Zusammenfassung

Anzeige

  • Rating:
  • Lizenz:
  • Freeware
  • Name des Herausgebers:
  • Jody Hey
  • Betriebssysteme:
  • Windows All
  • Dateigröße:
  • 103 KB

Simdiv Stichworte


Simdiv Beschreibung

SIMDIV wurde entwickelt, um ein Programm zu sein, das im Hey-Labor zum Erzeugen von Datensätzen unter einer Isolation mit Migrationsmodell verwendet werden kann. Es kann für mehrere Populationen für eine Vielzahl von Mutationsmodellen verwendet werden - ziemlich viel für jede Art von Datenset, für die IM und verwandte Programme verwendet werden können. SIMDIV ist nicht das einzige Programm, das dies tun kann. Es gibt viele andere kohlezierende Simulatoren da draußen, und einer, das ich kenne, kann für die Isolation mit Migrationsmodellen verwendet werden, ist Simcoal, aber es kann andere geben. SIMDIV simuliert Daten mit Rekombination, wenn die Benutzer so angibt, obwohl IM-Programme keine Rekombination annehmen. Das Programm kann bis zu 10 Populationen mit 350 Genkopien pro Locus für eine beliebige Anzahl von Loci verarbeiten. Wenn gewünscht, kann ein Benutzer alle mit einem echten Datensatz (# Loci, Sample-Größen, Mutationsmodellen und IM-Parameter-Schätzungen) zugeordneten Spezifikationen laden, damit IM / SIMDIV-Ergebnisse mit den tatsächlichen Daten verglichen werden können, die zur Erzeugung des Geräts verwendet wurden Parameterschätzungen. Für das Benutzer sollte SIMDIV ziemlich einfach zu bedienen sein, da Parameter dieselben Dinge bedeuten und in SIMDIV und den IM-Programmen auf dieselbe Weise skaliert werden.


Simdiv Zugehörige Software

SSA

ein Programm zum Inferrieren der maximalen Wahrscheinlichkeit von Phyogenien aus DNA-Sequenzen ...

483 368 KB

Herunterladen