Scheißen erzeugt Plots der ortsweisen Variation entlang einer Sequenzausrichtung
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Scheißen Ranking & Zusammenfassung

Scheißen Stichworte

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Scheißen Beschreibung

Der Name Shiat steht für Shannon Heterogenität im Alignment-Werkzeug. Shiat erzeugt Diagramme von Site-weisen Variationen entlang einer Sequenzausrichtung (einschließlich der Shannon-Entropie- und Hamming-Distanzmaßnahmen). Diese Anwendung bietet eine intuitive grafische Schnittstelle zur gleichzeitigen Berechnung von drei Maßnahmen der Sitewise-Variation in DNA- oder RNA-Ausrichtungen. Der Shannon-Informationsindex, der Hamming-Abstand und (1-Konsensfrequenz) werden alle berechnet und in einer Reihe grafischer Parzellen angezeigt. Mehrere Ausrichtungen können importiert und verglichen werden, und ein Datenansichtsfenster ermöglicht das einfache Kopieren und Einfügen in externen Anwendungen. Vier Maßnahmen werden implementiert: - Shannon Information Entropie (nach Position) - 1- (Konsensfrequenz) (nach Position) - 1- (Heterozygosität Index H) (nach Position) - Hamming-Abstand (paarweise über Ausrichtung summiert)

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