Normalisiertes Prädiction-Nutzen der Elutionszeit (NET) Berechnung vorhergesagte normalisierte Elutionszeitwerte für Peptidsequenzen
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Normalisiertes Prädiction-Nutzen der Elutionszeit (NET) Ranking & Zusammenfassung

Normalisiertes Prädiction-Nutzen der Elutionszeit (NET) Stichworte

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Normalisiertes Prädiction-Nutzen der Elutionszeit (NET) Beschreibung

Normalized Elution Time Time (NET) Die Prognosedienstprogramm ist ein kleines Dienstprogramm, das zur Berechnung der vorhergesagten normalisierten Elutionszeit-Werte (NET) für eine Liste von Peptidsequenzen ausgelegt ist. Die Elutionszeiten sind für die Verwendung mit umgekehrter Phasenflüssigkeitschromatographie (z. B. mit C18-beschichteten Siliciumdioxidpartikeln) vorgesehen, und werden in unserem Labor zur Ausrichtung von LC-MS- und LC-MS / MS-Datensätzen miteinander (unter Verwendung der vorhergesagten Elutionszeiten eingesetzt) um ein Master-In-Silico-Dataset zu bilden, um jedes Dataset an auszurichten). Die vorhergesagten Elutionszeiten werden auch vom Protein-Digestions-Simulator basic verwendet, wenn die Anzahl der einzigartig identifizierbaren Peptide innerhalb einer Eingabedatei mit beiden Netto berechnet wird. Das Netto-Prognose-Dienstprogramm liest die Peptide aus einer Textdatei, die eine Peptidsequenz in jeder Zeile enthält. Die Ausgabedatei enthält die Peptidsequenz sowie den vorhergesagten Nettowert (und / oder vorhergesagte SCX-Wert) mit einem oder allen Vorhersagealgorithmen: · Kangas / Petrit-LC-Retentionszeitmodell · Kangas / Petrit-SCX-Fraktionsmodell · KROKHIN-Hydrophobizitätsmodell · Mant-Hydrophobizitätsmodell

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