Jvirgel.

Eine Software zur Simulation und Analyse von Proteomics-Daten
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Jvirgel. Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Lizenz:
  • Freeware
  • Name des Herausgebers:
  • Karsten Hiller
  • Dateigröße:
  • 33.7 MB

Jvirgel. Stichworte


Jvirgel. Beschreibung

Jvirgel ist ein leistungsstarker Antrag, der die theoretischen isoelektrischen Punkte (PI) und den berechneten Molekulargewichten (MW) von Proteinen ermittelt. Es ermöglicht Ihnen auch, diese als virtuelle zweidimensionale (2D) -Protein-Karte zu visualisieren. Der Benutzer kann die Präsentation des berechneten 2D-Gels interaktiv durch Auswahl eines PI / MW-Bereichs und eines elektroprophoretischen Zeitkales von Interesse steuern. Haupteigenschaften: Import von Aminosäuresequenzen von Fasta-, EMBL-Datei oder von der produzischen Datenbank über XML Vorhersage und Visualisierung von Sekretomen Vorhersage und Visualisierung von Membran-Proteomen Übersetzung des Codon Adaption Index (CAI) in die Proteinspotgröße Ausschluss von Membranproteinen aus der Visualisierung Bilanzierung von Signalpeptiden und in der Silico-Spaltung, die zu einer höheren Vorhersagegenauigkeit des Pi und der MW führt Export von virtuellen Gels in PNG- oder JPG-Graphics Übereinstimmung eines experimentellen Gels mit einem virtuellen Gel mit unterschiedlichen Regressionsalgorithmen Zoomt in einen Benutzer wählbare pH / MW-Reihe Proteine können in Gruppen sortiert werden, und alle Daten können in CSV-Tables oder MS-Excel-Tabellen (MS-Excel-Tabellen) exportiert werden -Proteine können entsprechend ihrem Inhalt von Transmembran-Helices oder deren Wahrscheinlichkeit gefärbt werden


Jvirgel. Zugehörige Software

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