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Identifizieren Sie CIS-Regulierungsmodule mit der Promotoranalyse- und Microarray-Expressionsdatenregion ...
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 | Sbmlsqueezer.Erzeugen von kinetischen Gleichungen für biochemische Netzwerke |
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Sbmlsqueezer. Ranking & Zusammenfassung
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- Lizenz:
- Freeware
- Name des Herausgebers:
- University of Tübingen
- Betriebssysteme:
- Windows All
- Dateigröße:
- 3.1 MB
Sbmlsqueezer. Stichworte
Sbmlsqueezer. Beschreibung
SBMLSQUEEZER erzeugt kinetische Gleichungen für biochemische Netzwerke nach Kontext jeder Reaktion. Bei Verwendung als Plug-In für CellDesigner verwendet es die Informationen aus der SBGN-Darstellung aller Netzwerkkomponenten. Im Stand-Alone-Modus bewertet SBMLSQUEEZER die Annotationen der Systeme Biology Ontology (SBO), um diese Informationen zu extrahieren. Die Satzgesetze, die von SBMLSQUEEZER erstellt werden können, umfassen mehrere Arten von allgemeiner Massenaktionen. Detaillierte und generalisierte Enzymkinetik, verschiedene Arten von Hügelgleichungen, S- und H-Systemen sowie Additivmodelle für die Genregulation. Benutzerdefinierte Einstellungen geben an, welche Gleichung für jede Art von Reaktion und So gewährleisten Sie die Einheitskonsistenz des Modells. Gleichungen können mit kontextuellen Menüs erstellt werden. Alle neu erstellten Parameter sind mit der abgeleiteten Einheit ausgestattet und mit SBO-Begriffen, falls verfügbar und sinnvoller Textnamen angeboten. Mathml wird direkt in die SBML-Datei eingefügt. Latex oder Text exportieren von gewöhnlichen Differentialgleichungen. Geben Sie SBMLSQUEEZER ein, um seine Fähigkeiten vollständig zu bewerten!
Sbmlsqueezer. Zugehörige Software
