Modulemaster

Identifizieren Sie CIS-Regulierungsmodule mit der Promotoranalyse- und Microarray-Expressionsdatenregion
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Modulemaster Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Lizenz:
  • Freeware
  • Name des Herausgebers:
  • University of Tübingen
  • Dateigröße:
  • 6 KB

Modulemaster Stichworte


Modulemaster Beschreibung

Modulemaster ist eine neuartige Anwendung, um CIS-Regulierungsmodule (CRMS) in Sätzen von co-exprimierten Genen zu finden. Die Anwendung verfügt über eine neu entwickelte Methode, die nicht nur die Bindungsinformationen von Transkriptionsfaktor in Betracht zieht, sondern auch multivariate funktionelle Beziehungen zwischen den Regler und Zielgenen, um die Erkennung von CRMS zu verbessern. Modulemaster kann regulatorische Sequenzen aus einer großen Liste von Organismen analysieren. In diesen Sequenzen können Transkriptionsfaktor-Bindungsstellen erfasst und zusammen mit verschiedenen statistischen Messungen und Visualisierungen berichtet werden. Basierend auf diesen Bindungsstellen und Microarray-Expressionsdaten kann Modulemaster CIS-Regulierungsmodule erkennen. Das Programm verwendet einen multivariaten evolutionären Algorithmus, um nicht nur erhebliche Kombinationen von Bindungsstellen, sondern auch plausible Ausdruckskorrelation zu erkennen. Infolgedessen erhalten Sie eine Liste erheblicher Module sowie viele Informationen und Möglichkeiten, das Modul weiter auszuwerten und zu bestätigen. Holen Sie sich ModuleMaster und versuche es, genau zu sehen, wie nützlich es ist, dass es für Sie sein kann!


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