MrMODELTELST.

C-Programm zum Auswählen von DNA-Substitutionsmodellen mit PAUP
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MrMODELTELST. Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Lizenz:
  • GPL
  • Name des Herausgebers:
  • Johan Nylander
  • Betriebssysteme:
  • Windows All
  • Dateigröße:
  • 461 KB

MrMODELTELST. Stichworte


MrMODELTELST. Beschreibung

Vergleichen verschiedener Modelle der DNA Evolution ist eine Aufgabe, die für einen bestimmten Satz von Benutzern reserviert ist, der das notwendige Wissen hat, um nützliche Informationen zu extrahieren. Sie benötigen auch spezielle Werkzeuge, um den Betrieb durchzuführen, und MRMODELTSTEST ist ein Hilfsprogramm, das speziell für den Job entwickelt wurde. Dies kann einen Teil des Benutzers daraus distanzieren, obwohl einst einmal die ordnungsgemäße Anweisungen verwendet, um sie zu verwenden, und die unterstützten Befehle und Argumente. Der Entwickler informiert, dass das Instrument Wahrscheinlichkeitsverhältnis-Tests und AIC (AAIKAIKE Information-Kriterium) verwendet, was eine relative Qualität eines statistischen Modells für bestimmte Daten misst. Weitere Angaben des Entwicklers beziehen sich auf den Betrag der Modelle der Nukleotidersubstitution, die von der auf 24 eingestellten Anwendung unterstützt wird, und alle können in MrBayes-Werkzeug angegeben werden (verwendet für die Bayesian-Abschätzung der Phylogeney). Liste der unterstützten BefehleDespite Eine grafische Benutzeroberfläche, die mit MRMODELTSTEST arbeitet, ist möglicherweise nicht zu schwierig für die Ziele, da das Konsolenfenster die Liste der unterstützten Befehle anzeigt. Das Programm erlaubt es, die HLRT2 / 3/4-Hierarchie auszuwählen, sowie die Definition der Alpha- und Debug-Ebene. Beispiele werden auf dem Bildschirm dargestellt, um die Dinge einfacher zu machen. Es besteht auch die Möglichkeit, den AIC oder den LRT-Rechnermodus zu aktivieren und die Anzahl der Taxa zu setzen. Für die meisten Operationen gibt es zusätzliche Tooltips, die dem Benutzer helfen können. Vergleichen DNA Evolution-ModelleMRMODODELTST ist eine Gabel der modelltest-Anwendung, die fast doppelt so viel die Anzahl der Modelle der Nukleotidersubstitution unterstützt. Sein Vorteil ist jedoch, dass diese in MrBayes-Dienstprogramm zur Phylogeneschätzung implementiert werden können. Bewertet von ionut ilascu, letzte aktualisierte Aktualisierung am 2. Juni, 2014


MrMODELTELST. Zugehörige Software

SSA

ein Programm zum Inferrieren der maximalen Wahrscheinlichkeit von Phyogenien aus DNA-Sequenzen ...

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