Hapevolution.

erkennt Gentress-Interaktionen von den Fallkontrollhaplotypendaten
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Hapevolution. Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Lizenz:
  • Freeware
  • Name des Herausgebers:
  • Memorial University of Newfoundland
  • Betriebssysteme:
  • Windows All
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  • 1.6 MB

Hapevolution. Stichworte


Hapevolution. Beschreibung

Komplexe Erkrankungen umfassen mehrere Gene mit geringer Durchdringung, die über das Genom verteilt werden können. Die meisten der aktuellen Haplotyp-Assoziationsmethoden sind typischerweise in der Länge eingeschränkt und bestehen aus Allelen aus zusammenhängenden SNPs. Diese Ansätze haben eine begrenzte Kapazität, um Epistase aus mehreren Gen-Gentress-Wechselwirkungen zu erkennen. Die jüngsten Beweise haben gezeigt, dass die 3-D-Struktur von Chromosomen eine Rolle spielen kann, um SNPs zu ermöglichen, mit genetischen Elementen zu interagieren, die physikalisch durch große Entfernung getrennt sind. Hapevolution ist ein professioneller Antrag, der zum Implementieren eines koeverativen Koevolutionar-Algorithmus (CCA) zur Ermittlung von Gen-Gentres-Wechselwirkungen von Fallsteuerungshaplotypendaten ausgelegt ist; Darüber hinaus kann dieser Algorithmus bis zu 15% fehlende / mehrdeutige Positionen in Haplotypdaten tolerieren, die während des Haplotyps aus Genotypen ergeben. Ferner kann der Algorithmus epistatische Assoziationen von Genen von mehreren Chromosomen berechnen.


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