Proteqfetch.

Laden Sie Proteinsequenzen mit Leichtigkeit herunter.
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Proteqfetch. Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Lizenz:
  • GPL
  • Name des Herausgebers:
  • pauleym
  • Betriebssysteme:
  • Windows All
  • Dateigröße:
  • 263 KB

Proteqfetch. Stichworte


Proteqfetch. Beschreibung

ProteqFetch ist eine kleine, java-basierte Anwendung, die speziell entwickelt wurde, um Proteine-Sequenzen aus der NCBI- oder NR-Datenbank herunterzuladen. Diese Software bietet diese Werkzeuge an: Sequenzdaten herunterladen: Es werden zwei Optionen bereitgestellt, um Sequenzdaten von der NCBI- oder lokalen NR-Datei herunterzuladen. Liste der Organismen hochladen: Dem Benutzer werden zwei Optionen zur Hochladen der Liste von Organismen bereitgestellt. Einer ist durch Tastatur, indem man den Organismus in ein Textfeld eindringt. Der zweite Weg ist, indem Sie eine Datei mit einer Liste von Organismen auswählen. Die Sequenzen werden in das Verzeichnis Downloads in die nrsequensisi.fa-Datei heruntergeladen. Wenn auf redundanten Sequenzen gefunden wurden, werden sie in der Datei redsequences.fa gespeichert. NR-Datenbank herunterladen: Diese Funktion stellt den Benutzer zur Herunterladen der NR-Datenbank von NCBI in das lokale System herunter. Es gibt insgesamt 4 Teile von NR.00 bis NR.03 zum Download. Der Benutzer muss eingeben, in welchem Teil heruntergeladen werden soll (von 0 bis 3). Jede Datei ist ungefähr 800 MB groß. und kann mehrere Stunden dauern, um basierend auf Ihrer Internetgeschwindigkeit herunterzuladen. Überprüfen Sie den Organismus: Dieses Dienstprogramm kann verwendet werden, um die Richtigkeit des angegebenen Organismennamens durch Anschluss an NCBI zu überprüfen und zu validieren.


Proteqfetch. Zugehörige Software