FPG simuliert eine Population konstanter Größe
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FPG Ranking & Zusammenfassung

FPG Stichworte

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FPG Beschreibung

Der Name FPG steht für die genetische Simulation der Vorwärtsbevölkerung. FPG simuliert eine Population konstanter Größe, die verschiedene evolutionäre Prozesse unterstreicht, darunter: Mutation, Rekombination, natürliche Selektion und Migration. Die Bedeutung von "Forward" in diesem Zusammenhang ist einfach diese Zeit, in der Simulation, genauso wie in der realen Welt nach vorne. Dies ist im Gegensatz zur kohleselbetrieblichen genetischen Simulation mit kohlezierender Bevölkerung, in der in welcher Zeit in der Simulation dargestellt, in die Vergangenheit zurück. Koaleszentensimulationen haben viele Vorteile, aber sie sind unhandlich, wenn sie die natürliche Auswahl auf mehrere Standorte enthalten. FPG ist nützlich, um die Auswirkungen der natürlichen Auswahl auf Muster der genetischen Variation zu bewerten. Es ist so konzipiert, dass er in der Lage ist, echte Situationen mit relativ großen Bevölkerungsgrößen und hohen Mutationsraten über langen DNA-DNA annähernd anzunehmen. Das Mutationsmodell ist ein unendliches Site-Modell, was bedeutet, dass kein Standort, der in der Bevölkerung trennen, eine weitere Mutation erhalten kann. Die Simulation beherbergt neutrale, vorteilhafte und schädliche Mutationen unter verschiedenen Fitnessmodellen, einschließlich additiver, multiplikativer und epistatischer Fitness-Modelle. Das Programm erzeugt eine Vielzahl von Analysen, darunter Polymorphismen, Heterozygosität (beobachtet und erwartet), Fixierraten und Verknüpfung Ungleichgewicht - alle für jede von mehreren Kategorien der Mutation. Wenn Migration in Aufruf in Bezug auf die Bevölkerung erfolgt, werden mehrere Analysen in Bezug auf die Bevölkerungsstruktur durchgeführt. Der grundlegende Lebenszyklus wechselt zwischen hapolloffen Genomen (Gameten) und diploiden Genomen (Zygoten) und erfolgt wie folgt: - Gameten werden zufällig in Zygoten gepaart - Die Fitness wird für jede Zygote als Funktion der Mutationen gemessen, die sie trägt. Wenn Dominanz auf 0,5 eingestellt ist, ist das Modell in anmitten eines haploiden Auswahlmodells ähnlich. - Reproduktionserfolg ist die Anzahl der Gameten, die zur nächsten Generation beigetragen wurden, und wird für jede Zygote ermittelt, indem sie von einer multinomialen Verteilung mit den Erwartungen zeichnet, die die relativen Fitnesswerte jeder Fitnessklasse sind. - Rekombination und Mutation treten während der Produktion von Gameten auf - Wenn es mehrere Populationen gibt, werden Gameten zufällig von jeder Bevölkerung gezogen und zufällig in andere Bevölkerungen gelegt. Diese Gameten, die von Migranten vertrieben werden, gehen verloren, sodass Migration ein zusätzliches Element der genetischen Drift hinzufügt. Dies ist ein Inselmodell der Migration - Neue Zygoten werden von der zufälligen Vereinigung von Gameten gebildet. Generationen sind nicht überlappend.

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