3dicsi. Analysieren Sie die CSI-Daten schnell und einfach.
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3dicsi. Beschreibung

3DICSI ist eine kleine, einfache, einfach zu bedienende Anwendung, mit der Sie dabei helfen, die Daten der chemischen Umschaltbilder (CSI) zu interpretieren. Es kombiniert Datenvisualisierung, spektrale Verarbeitung, spektrale Lokalisierung und Schätzung, spektrale Quantifizierung zusammen mit mehreren Variablenanalyseverfahren, wie z. B. die Hauptkomponentenanalyse (PCA) und die eingeschränkte nicht negative Matrixfaktorisierung (CNMF). Insbesondere bietet CNMF einen effizienten Weg, um zugrunde liegende Spektralmuster, die physisch sinnvoll sind, wiederherzustellen. Haupteigenschaften: Dateneingabe und Visualisierung: Automatische Einfuhr von 1D / 2D / 3D-CSI-Rohdaten von Philips, GE, Siemens und Bruker Scanner. Jeder unbekannte Datentyp kann durch manuelles Eingeben von Parametern importiert werden. Alle zusätzlichen Formate werden auch durch Plug-Ins von Drittanbietern unterstützt. CSI-Daten und anatomische Referenzbilder werden registriert und in demselben Fenster angezeigt. Jeder Voxel wird in einem separaten Fenster angezeigt, deren räumliche Speicherort in den drei orthogonalen Bildfenstern eindeutig visualisiert. 3D-Bildrekonstruktion aus Bildern in einer Orientierung. Multi-dimensionale spektrale Datenverarbeitung: Konstante Phase- und lineare Phasenkorrektur. zeitliche Filterung (Lorentzian, Gaußscher oder kombiniert). räumliches Glätten (Hamming, Cosinus, Fermi). Baseline-Korrektur. Wasserunterdrückung. PPM-Ursprungseinstellung und Nullfüllung. Lipidunterdrückung. Peak-Ausrichtung. Batch-Verarbeitung: Sequenz von Verarbeitungsschritten kann in einer Makrodatei aufgezeichnet und an den CSI-Datensatz angewendet werden. Dieselbe Makrodatei kann auf eine Reihe von Prüfungen in einem Batch-Modus angewendet werden. Spektrale Lokalisierung: Echtzeit-Maus-erleichterte interaktive Voxel-Verschiebung in allen 3 Dimensionen. Mittelwertbildung ausgewählter mehrerer Voxel. Spectral-Schätzung eines Benutzers, der 2D / 3D-Region von Interesse gezogen wurde. Multi-Variate-Spektralanalyse: Hauptkomponentenanalyse (PCA) für benutzerdefinierte Spektralbereich und ROI, um Hauptkomponenten (PCs) für die im CSI-Datensatz enthaltenen Variationsquellen zu identifizieren. PCA-basierter iterativer Peak-Richtige, um Frequenz- und Phasenvariationen zu entfernen. Eingeschränkte nicht negative Matrixfaktorisierung (CNMF) -Methode zur Wiederherstellung von Spektralmustern und deren räumlichen Verteilungen, die physikalisch sinnvoll sind. Spektrale Quantifizierung: Metabolic Kartenerzeugungsleitmaschine Bereich Integration mit und PCA. Karte Generation für Peak-Verhältnis und für benutzerdefinierte Regionen. Absolute Quantifizierung der Metaboliten-Konzentration Referenzspektrum verwendet. Maßstab Kartenanzeigeeinstellung Vergleich zwischen verschiedenen Sätzen zu ermöglichen. Spectral Integration mit benutzergesteuerten Basislinienkorrektur. Datenausgang: Verschiedene Ergebnisausgabeoptionen wie HTML-Format Bericht, CSI in Scheiben schneiden und Bild ausdrucken, Anzeige Kopie und Funktionen einfügen, spektrale ascii / binary Ausfuhr, metabolisches Bild Export. Programm Erweiterbarkeit: Plug-in-Mechanismus CSI-Daten Einfuhr Modul von Drittanbietern entwickelt unterstützen.

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