Clans

Ein kleines Werkzeug, das in Java zur Clusteranalyse von Sequenzen geschrieben wurde.
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Clans Ranking & Zusammenfassung

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  • CLANS Team
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Clans Stichworte


Clans Beschreibung

Häufig wird Homologie als Grund zur Übertragung von Wissen über die Funktion oder Struktur von bekannten Proteinen verwendet. Obwohl Phyogenien die Methode der Wahl sind, wenn der Versuch, Homologie zu bestimmen, ist der am häufigsten verwendete Marker die kairezige Sequenzähnlichkeit. Das Problem der Suche nach Gruppen mit koazulierter Gene über eine Reihe von Microarray-Experimenten ist dem Problem, Gruppen homologer Proteine in einem großen Datensatz zu finden. In beiden Fällen haben wir große Datenmengen und suchen nach diesen wenigen Genen, die eine Art signifikanter Ähnlichkeit zeigen. Die mutmaßliche Co-Regulierung sowie die mutative Homologie werden in der Regel aus Ähnlichkeiten in der Feature-Set eines Gens abgeleitet. In dem ersten Fall besteht der Merkmalssatz aus den Expressionsniveaus über die Experimente im zweiten Fall der Aminosäuresequenzen der Proteine. Eine gewisse Ähnlichkeit ist auch ersichtlich, wenn Sie die Diagramme betrachten, die entweder für Proteinsequenzdaten oder Microarray-Daten erzeugt werden. Holen Sie sich Clans und nehmen Sie es für einen Spin, um zu sehen, was es eigentlich für Sie tun kann!


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