Asatura Sättigung in Nukleotidsequenzen demonstrieren
Jetzt downloaden

Asatura Ranking & Zusammenfassung

Asatura Stichworte

Reihenfolge Sättigungseffekt Ventilsättigung Sättigung Sättigungs Shaper Sättigungsalgorithmus Bandsättigung Sättigungssimulation schwarze Sättigung Sättigungseinsteller. Sättigung anpassen Sättigung ändern Sättigung korrigieren bedingte Sättigungsänderung Photoshop Sättigung. 3d Planeten-Generator Nukleotid-Anteil Mutation Sättigungsspur Nukleotidsequenz Nukleotidsequenzmanager Nukleotide Wandlersättigung Sättigungssimulator analoge Sättigungs Sättigung modifizieren Sättigungsmodifizierer korrekte Sättigung Nukleotid-Substitutionsmodell Nukleotidmotiv zeigen Nukleotidersubstitution. Nukleotidannotation. Nukleotidausrichtungen. Nukleotid-Polymorphismen. Nukleotidmutation. Nukleotidfraktion Pacific Islands Screensaver. Kostenloser Java-Antivirus. Codec-Datei FLV. SWF nach FLA. wie man liest BitTorrent Lite. Doodle-Sprung 1.8.2. Yahoo Video roxxana VERSA-Prüffahrer BlackBerry 1800 Software. Karaoke-Song CDG.

Asatura Beschreibung

Die übliche Art, Sättigung in Nukleotidsequenzen zu demonstrieren, besteht darin, den Bruchteil der Unterschiede zwischen Sequenzen gegen den evolutionären Abstand zu zeichnen, der sie trennen. Wenn die Anzahl der beobachteten Unterschiede, beispielsweise zur Fraktion von dritten Codon-Positionen, nicht mehr mit zunehmendem evolutionärem Abstand ansteigt, soll die Sequenz gesättigt sein. Die gleiche Technik kann auf Aminosäuresequenzen angewendet werden. Wir haben eine Java-Anwendung als Asatura entwickelt, die AA-Substitutionen mit hohen und niedrigen Wahrscheinlichkeiten des Auftretens diskriminiert. Alle AA-Ersetzungen sind entweder als "häufig" oder als "selten" definiert, abhängig von ihren Mutationswahrscheinlichkeiten, die aus Substitutionswahrscheinlichkeitsmatrizen wie dem bekannten PAM und Blosum abgeleitet werden. Diese 20 mit 20 Matrizen liefern die empirisch abgeleiteten Wahrscheinlichkeiten eines AA, der durch einen anderen ersetzt wird, wenn Sequenzen über einen gewissen evolutionären Abstand abgestimmt sind. Die ASATURA-Anwendung sortiert alle Substitutionen gemäß diesen Wahrscheinlichkeiten, und ein Wahrscheinlichkeitsgrad-Wert kann ausgewählt werden, das zwischen häufigen und seltenen Substitutionen unterscheidet. Für jedes Sequenzpaar pflückt das Programm die Anzahl der beobachteten häufigen und seltenen AA-Ersetzungen gegen ihre evolutionäre Entfernung. Durch Änderung der Subitationswahrscheinlichkeit 'Cut-off' -Wert, kann die Anzahl der als häufigen oder seltenen AA-Substitutionen geändert werden. Idealerweise spaltet sich die sorgfältige Auswahl des 'Cut-Off-Werts den ursprünglichen Daten in einen gesättigten und ein ungesättigter Daten. Neben den am häufigsten verwendeten Substitutionswahrscheinlichkeitsmatrizen wie PAM, Blosum, MTREV24 und JTT können benutzerdefinierte Matrizen auch verwendet werden.

Asatura Zugehörige Software