Vmd. kostenlos herunterladen, Vmd. Download auf Software - Download

Ein molekulares Visualisierungsprogramm zum Anzeigen, Animieren und Analysieren großer Biomolekularsysteme mit 3-D-Grafiken. VMD ist ein molekulares Visualisierungsprogramm zum Anzeigen, Animieren und Analysieren großer biomolekulare Systeme mit 3-D-Grafiken und eingebauter Scripting. VMD unterstützt Computer, auf denen Mac OS X, UNIX oder Windows ausgeführt wird, kostenlos verteilt, und enthält Quellcode.VMD ist ein molekularer Grafikprogramm, das für die interaktive Visualisierung und Analyse von Biopolymeren wie Proteinen, Nukleinsäuren, Lipiden und Membranen ausgelegt ist .Vmd ist eine allgemeine Anwendung zum Anzeigen von Molekülen, die eine beliebige Anzahl von Atomen enthalten, und ähnelt anderen molekularen Visualisierungsprogrammen in seinen Basisfunktionen. auch als Desktop-Grafik-Workstations. Sterescopic-Anzeige hilft bei der Wahrnehmung von dreidimensionalen Strukturen erheblich und ist seit seiner ersten Version eine Schlüsselfunktion in VMD. VMD bietet auch Unterstützung für kostengünstige gameorientierte Stereo-Gläser und sogar anaglypher (rot / blau) Stereo. Hier sind einige wichtige Funktionen von "VMD": · Keine Begrenzung der Anzahl der Moleküle, Atome, Rückstände oder Anzahl der Animationsrahmen, außer verfügbarer Speicher. · Viele molekulare und volumetrische Rendering- und Farbmethoden. · Umfangreiche Atomauswahlsprache mit booleschen und algebraischen Bedienern, regulären Ausdrücken, entfernten Auswahlen und mehr. · Umfangreiche Grafik- und Textschnittstellen in TCL, TK und Python, um leistungsstarke Skript- und Analysefunktionen bereitzustellen. · Hochwertiges Bildschirm-Rendering mit OpenGL-Programmierbarer Shading an erweiterten Grafik-Beschleunigern. · Stereoskopisches Display mit Shutterbrillen, autostereoskopische Flachplatten, Anaglyphen-Stereo-Gläser und seitlich-by-seitiger Stereo-Ansicht. · 3-D-interaktive Steuerung durch Verwendung von Joysticks, Weltraumballen, haptischen Geräten und anderen erweiterten Eingabegeräten mit Unterstützung für das periphere Netzwerk des virtuellen Realität (VRPN). · Ein dehnbares pluginbasiertes Dateiladungssystem mit Unterstützung für beliebte Formate wie Bernstein, Charm, Gromacs, NAMD, PDB, X-Plor und viele andere sowie automatische Umwandlung durch Babel. · Exportanzahl der angezeigten Szene auf elektrische Rendering-Formate einschließlich POV-Ray, Raster3D, Renderman, Gelato, Tachyon, Wellenfront sowie STL- oder VRML2-Dateien für 3-D-Druck. · Integration mehrerer Sequenzausrichtung und evolutionäre Analysewerkzeuge in Form des Multiseq-Plugins und dessen entsprechende Werkzeugset. · Führen Sie die interaktiven Molekulardynamik (IMD) -Simulationen mit NAMD, Protomol oder anderen Programmen als Simulation zurück. · Integration mit dem Programm NAMD, einem schnellen, parallelen und skalierbaren molekularen Dynamik-Programm, das in Verbindung mit VMD entwickelt wurde. Weitere Informationen finden Sie in der Namd-Seite: http://www.ks.uiuc.edu/research/namd · Integration mit der biocore-kollaborativen Forschungsumgebung. VMD kann "Publizieren" molekulare Grafikskripts an Biocore, so dass Kollaboratoren über das Internet zusammenarbeiten können. Weitere Informationen finden Sie auf der Biocore-Seite: http://www.ks.uiuc.edu/research/biocore. Einschränkungen: · Sie müssen sich registrieren, um herunterzuladen, um herunterzuladen. Was ist neu in dieser Version: · Benutzerdokumentation Updates · Kleinere Verbesserungen und Korrekturen in der VMD-Benutzerhandbuch, zusätzliche Dokumentation für neue Befehle und Umgebungsvariablen. · Neue und aktualisierte Tutorials für erweiterte Bilder und Filmherstellung, 3-D-PDF-Export, Tachyon-Ambient-Okklusionsbeleuchtung, elektrostatische Oberflächenfärbung und Dichte-Map-basierte Atom-Auswahl. · Benutzeroberfläche ändert sich · Neuer Auswahlmodus "Benutzer" für den Einsatz mit benutzerdefinierten Skripts und Plugins · Allgemeine Verbesserungen · Unterstützung für 3-D-Erfassung mit Acrobat 3-D, zur Erzeugung von Dokumenten, die 3-D-Molekülstrukturen einbetten. · VMD-Renderings können nun Tachyons Advanced Umgebungs- Okklusionsbeleuchtung für enorm verbesserte 3-D-Renderings molekularer Grafiken verwenden. Dieser fortschrittliche Beleuchtungsmodus kann die Abschattung von Poren und Kanälen, Strukturen mit Hohlräumen und anderen Fällen erheblich verbessern, was typischerweise die Verwendung von Tiefenschreibern für eine bessere Tiefenwahrnehmung erfordern. · VMD unterstützt nun das NVIDIA-GPU-GPU-beschleunigte Produktionsqualitäts-Rendering-Paket. VMD exportiert Szenen in das native Pyg-Dateiformat von Gelato sowie das Render-RIB-Format. · Standardmäßig verwendet VMD jetzt alle verfügbaren Prozessoren, um parallelisierte Portionen des Codes zu beschleunigen, die derzeit mehrere Strukturanalyse-Routinen, interaktive MD- und Ray-Tracing enthalten. · Die Verwendung des gesamten Atomspeichers wurde erheblich verringert. VMD verwendet nun nur noch mehr als halb so viel Speicher pro Atom, verglichen mit früheren Versionen, wobei mehr Platz für zusätzliche Flugbahnrahmen verfügbar bleiben oder mehr Moleküle auf einmal geladen werden. · VMD-Strukturladungs- und Analyse-Skalierbarkeit wurden erheblich verbessert. VMD wurde erfolgreich geprüft und die Strukturen von bis zu 72.000.000 Atomen analysiert. · Der automatische Anleihenbestimmungsalgorithmus betreibt nun auf einzelne Prozessorsysteme bis zu dreimal schneller, und verwendet mehrere Prozessoren für eine verbesserte Leistung auf Multicore-Prozessoren und Multiprozessor-Workstations. · Drastisch verbesserte, mehrtausend-Datei-Struktur-Ladeleistung, wenn das Display-Update deaktiviert ist. Diese Vorteile Batch-Modus VMD-Analyse-Jobs, die eine Analyse von Tausenden von Strukturen, z. Laden und Durchsuchen von großen Teilmengen der PDB.

Vmd. Zugehörige Software