Topographica. Ein universeller neuronaler Simulator, der sich auf topographische Karten fokussiert
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Topographica. Ranking & Zusammenfassung

Topographica. Stichworte

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Topographica. Beschreibung

Ein allgemeiner neuraler Simulator, der sich auf topographische Karten konzentriert Topographica ist ein Softwarepaket für die Rechenmodellierung von neuronalen Karten, die von der Forschungsgruppe der Neural Networks an der Universität Texas in Austin und dem Institut für adaptive und neuronale Berechnung an der University of Edinburgh entwickelt wurde. Das Projekt wird vom NiMH Human Brain-Projekt finanziert Unter Grant 1R01-MH66991. Ziel ist es, den Forschern zu unterstützen, die Hirnfunktion auf der Ebene der topographischen Karten zu verstehen, die sensorische und motorische Systeme bilden Diese Simulatoren konzentrieren sich auf die Modellierung des detaillierten internen Verhaltens von Neuronen und kleinen Netzwerken von ihnen.ToPographica konzentriert sich stattdessen auf die große Struktur und Funktion, die nur sichtbar ist, wenn viele Tausende solcher Neuronen in topographische Karten mit Millionen von Verbindungen verbunden sind. Viele wichtige Phänomene können nicht ohne solche großen Netzwerke untersucht werden, einschließlich der zweidimensionalen Organisation von visuellen Orientierungs- und Bewegungsrichtungskarten sowie Objektsegmentierungen und Gruppierverfahren. Um solche Modelle praktisch zu machen, ist die Grundeinheit ein Blatt Neuronen, eher als ein Neuron oder ein Teil eines Neurons. Für die meisten Simulationen können die Blätter auf hohem Niveau implementiert werden, bestehend aus abstrakten Brennraten- oder Integration-und-Feuer-Neuronen. Bei Bedarf für die Validierung oder für bestimmte Phänomene kann Topographica mit einem Blatt leicht erweitert werden, der in anderen Simulatoren zu detaillierteren Neuronenmodellen ist. Weniger detaillierte Blätter können auch vorübergehend verwendet werden, z. wenn Sie mit dem Modell in Echtzeit interagieren. Topographica macht es einfach, ein angemessenes Maß an Komplexität und Details zu nutzen, was durch die verfügbare Rechenleistung bestimmt wird, die für Validierung und Phänomen von Interesse verfügbare biologische Daten ermittelt wird. Was ist neu in dieser Version: Allgemeine Verbesserungen: · Erhebliche Leistungsverbesserungen in Simulationen (fast 2x insgesamt), Plotten (2x) und Inbetriebnahme · Kleinere Bugfixes. · Weitere Optionen zum Hinzufügen von Rauschen für Anschlussfield-Formen · Optionale Zeilen-by-line-Profilierung · Optionales Zythonpaket zum Schreiben schneller Komponenten Befehlszeile und Charge: · -V- und -d-Optionen zum Drucken von BEBOSE- und Debugging-Nachrichten · Neue Optionen für run_batch und bessere Fortschrittsnachrichten · Ersetzt die meisten Befehle mit parametrierten Funktionen, die dokumentierten, vom Typ- und gebundenen geprüften Argumenten aufweisen und die Erbschaft der gemeinsam genutzten Funktionalität ermöglichen · Ersetzte Kartenmessbefehle in topo.command mit einfacherer, allgemeiner Zweck, einfach. · Save_PlotGroup: nützliche Standardwerte; Die Ergebnisse können zwischengespeichert werden, um eine Empfehlungsrekomputation zu vermeiden · Messen_sine_pref: Allzweckmessung für jegliche Präferenz, die mit einem Sinusgitter getestet werden kann · Geänderte Einheimische mit den Parametern der Skriptebene mit GlobalParams; Siehe Beispiele / Lissom.ty · Made GradientPlot und FFTPlot im Batch-Modus. GUI: · Der Modell-Editor unterstützt nicht-Blatt-Eventprozessoren und Nicht-CFProjektion EPCONNOFES · Klicken Sie mit der rechten Maustaste zur Verfügung, um Tuning-Kurven zu planen · Plotfenster können in 2D arrangiert werden, nicht nur eine Reihe (siehe Sheet.Row_PreceDence) Beispiel-Skripts: · Beispieldatei zur Anbindung an externe Simulatoren (Beispiele / Perrinet_retina.ty) · Veraltete oder vorübergehende Beispiele entfernt · Erhebliche vereinfachte beispielhafte Beispielskripts · Verwenden Sie nun GlobalParams, um eine konsistente Optionseinstellung mit -P zu unterstützen · Erlaubt das Speichern lokaler Funktionen und Instanzmethoden-Anrufe in Snapshots Komponentenbibliothek: · Pattengeneratoren: Übersetzer; Der Parameter Mask_Shape ist auch einfach, um eine Maske für jedes Muster anzugeben, z. in der gui. · TransferFNs (früher als OutputFns genannt): Halberectifyandpower, Hysterese und HomöostatikResponse · Blätter: Aktivitätskopie · Learningfns: CFPLF_BCMFIXED_OPT, CFPLF_SCALED_OPT · HABlist-Parameter an FEATUREEVERSPONSES und LISSOM hinzugefügt, um das Hinzufügen von benutzerdefinierten Funktionen einfacher zu gestalten. · Geänderte Namen und Definitionen verschiedener ähnlicher Konzepte (OutputFn, Vore_Presentation, update_command, plot_command usw.), um das gemeinsame Konzept von Haken und Hakenlisten zu widerspiegeln (Listen von Callables, um an bestimmten Stellen im Code auszuführen). · Parameter: Grenzen können jetzt exklusiv, optionale Unterstützung für nicht in den meisten Typen

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