Tandemizer Frei- und Open-Source-Tool, mit dem Sie die Anordnung der gesamten Genom visualisieren können
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Tandemizer Ranking & Zusammenfassung

Tandemizer Stichworte

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Tandemizer Beschreibung

Frei- und Open-Source-Tool, mit dem Sie die Anordnung der gesamten Genom visualisieren können Tandemizer, das die Ausgabe von der Mummer-Suite "Exact-Tandems" -Programm verwendet, kombiniert mit Gesamtgenomsequenzen und optionalen Genebank-Dateien, um Registerkarten zwischen zwei oder mehr prokaryotischen Ganzen Genomes grafisch zu vergleichen.Tandemizer ist ein erweiterbares, flexibles Werkzeug, das die Visualisierung von ermöglicht Ganzgenomanordnung zwischen vielen Genomen basierend auf Registerkarten, mit Korrelationen an Genebank Annotationen für Gene und andere Merkmale sowie zum Drilldown auf die Sequenzebene für die Polymorphismusanalyse. Tandemizer wurde verwendet, um nach Korrelationen mit Markern für Virulenz- und Antibiotika-Resistenz zu suchen, um den Umzugsgrad der Verwandtschaft in den Genomen von Staphylokokken, Streptococcus und Francisella visuell zu bewerten, und die Beurteilung der Beziehung von Elementnote: Tandemizer ist lizenziert und verteilt unter den Bedingungen der Akademische und Forschungslizenz. Anforderungen: · Java

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