SPDBV. ui, um mehrere Proteine gleichzeitig zu analysieren
Jetzt downloaden

SPDBV. Ranking & Zusammenfassung

SPDBV. Stichworte

analysieren Protein Struktur Protein analysieren Proteinanalysator. Protein anzeigen.

SPDBV. Beschreibung

UI zur Analyse mehrerer Proteine gleichzeitig Swiss-PDBViewer (SPDBV), AKA DeepView, ist eine Anwendung, die eine benutzerfreundliche Schnittstelle bietet, die die Analyse mehrerer Proteine gleichzeitig analysieren kann. Die Proteine können überlagert werden, um strukturelle Ausrichtungen abzuleiten und ihre aktiven Sites oder anderen relevanten Teilen zu vergleichen. Aminosäurermutationen, H-Bindungen, Winkel und Entfernungen zwischen Atomen sind dank der intuitiven Grafik- und Menüinterfends leicht zu erwerben.Moreover, Swiss-PDBViewer ist eng mit Swiss-Model verbunden, ein automatisierter Homologie-Modellierungsserver, der sich im Schweizer Institut entwickelt hat Bioinformatik (SIB) in Zusammenarbeit zwischen GlaxoSmithkline RD und der strukturellen Bioinformatik-Gruppe am Biozentrum in Basel.Decting mit diesen beiden Programmen verringert die Menge der Arbeit, die zum Generieren von Modellen erforderlich ist, da es möglich ist, eine Proteinprimärsequenz auf eine 3D-Vorlage zu fädeln und erhalten Sie ein sofortiges Feedback, wie gut das Gewindeprotein von der Referenzstruktur akzeptiert wird, bevor Sie eine Anforderung zum Erstellen von fehlenden Loops einreichen und Sidechain Packing.Swiss-PDBViewer ist auch in der Lage, Elektronendichtekarten zu lesen, und bietet verschiedene Werkzeuge zum Aufbau von Electron Density. die Dichte. Darüber hinaus sind mehrere Modellierungswerkzeuge enthalten, und Befehlsdateien für populäre Energieminimierungspakete können generiert werden. Was ist neu in dieser Version: · Das Thymin-C6-Atom ist jetzt korrekt geladen. · Die Endlosen-Schleife der POV-Ray-Ausgabe auf der PC-Version behoben. · Der gelegentliche Absturz beim Speichern von PDB-Dateien (z. B. 2I37) auf dem PC wurde behoben. · Aktualisierte die Adresse des UPPSALA Electron Density Map Servers.

SPDBV. Zugehörige Software