SEQAN. Ranking & Zusammenfassung
- Name des Herausgebers:
- SeqAn Team
- Website des Verlags:
- http://www.seqan.de/
- Betriebssysteme:
- Mac OS X
SEQAN. Stichworte
SEQAN. Beschreibung
Kostenlose und C ++ - Sequenzanalyse-Bibliothek SEQAN ist eine freie und offene C ++ - Bibliothek von effizienten Algorithmen und Datenstrukturen für die Analyse von Sequenzen mit dem Fokus auf biologische Daten. SEQAN wendet ein einzigartiges generisches Design an, das hohe Leistung, Erweiterbarkeit, Allgemeinheit und Integration mit anderen Bibliotheken garantiert.Seqan ist einfach zu bedienen und vereinfacht die Entwicklung neuer Software-Tools mit einem minimalen Leistungsverlust. Was ist neu in dieser Version: · 5 weitere Anwendungen, d. H. DFI, Microrazers, PaarIGN, SEQCONS, TREERECON · Stabile Freigabe von Rasierer, die gepaartes Ende-Lese-Mapping und konfigurierbare Empfindlichkeit unterstützen · Neue Ausrichtungsalgorithmen, z.B. gebundene, konfigurierbare Ausrichtungen (Überlappung, semi-global, ...) · Neuausrichtungsalgorithmus. · NGS-Datenstrukturen und -formate, z.B. Sam, Amos, ... · Neue Alphabete, z.B. DNA mit Basisrufqualitäten, Profilfiguren · Hilfsdatenstrukturen und Algorithmen, z. Doppelte Queue, Befehlszeilenparser · Positionswerte. · CMAKE-Unterstützung
SEQAN. Zugehörige Software