Rasierer ein Werkzeug zum Abbilden von Millionen kurzer Genom-Lesungen gegen ein Referenzgenom
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Rasierer Ranking & Zusammenfassung

Rasierer Stichworte

Karte importieren Genom Lesen Sie Mapper. Map Genome Read. Multifasta-Importeur. Genom lesen.

Rasierer Beschreibung

Ein Werkzeug zum Abbilden von Millionen kurzer Genoms liest gegen ein Referenzgenom Rasierer wurde mit Fokus auf das Abbilden der Sequenzierung der nächsten Generation entworfen. Razer sucht nach Übereinstimmungen von Liegestunden mit einer prozentualen Identität über einem bestimmten Schwellenwert, wobei es Spiele mit Mismatches sowie Lücken erkennt. Rasierer verwendet einen K-Mer-Index aller Lesungen und zählt gemeinsame K-MERS von Reads und das Referenzgenom in Parallelogrammen . Jedes Parallelogramm mit einer K-Mer-Anzahl über einem bestimmten Schwellenwert löst eine Überprüfung aus. Bei Erfolg werden die genomische Annahme und die Leseanzahl in die Ausgabedatei gespeichert und geschrieben. Suppreted-Plattformen sind: Mac OS X, Windows, Linux und Linux 64. Hier sind einige wichtige Funktionen von "Rasierern": · Import von Multifasta-Lese- und Genom-Dateien · Liegestütze können beliebige Länge sein · Unterstützt Hamming- und Bearbeitungsabstandsabdeckungszuordnung mit konfigurierbaren Fehlerraten · Konfigurierbare und vorhersehbare Sensibilität (Laufzeit- / Empfindlichkeits-Kompromisslosigkeit) Was ist neu in dieser Version: · Drastisch verringerter Speicherverbrauch · Hinzugefügt: "- Purge-Mehrdeutige" und "-Distanzbereich" -Optionen · Geändertes Verhalten "--max-Hits"

Rasierer Zugehörige Software