Phylokoko. Phylokoko - ein einfaches Werkzeug zur molekularen phylogenetischen Schätzung.
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Phylokoko. Ranking & Zusammenfassung

Phylokoko. Stichworte

Molekül phylogenetisch wieder aufbauen molekulare Phylogenetik. Phylogenies neu erstellen Wahrscheinlichkeitskriterium

Phylokoko. Beschreibung

Phylokoko - ein einfaches Werkzeug zur molekularen phylogenetischen Schätzung. Phylokoko ist ein freies und minimalistisches Werkzeug für molekulare Phylogenetika, das die Phyogenien mittels des Wahrscheinlichkeitskriteriums wieder aufbauen kann. Phylococo wählt automatisch das beste Substitutionsmodell der DNA-Evolution für den Dataset von Sequenzen, die nach kurzer Zeit nach kurzer Zeit analysiert und dargestellt werden, die beste bisherige Phylogenie gefunden.Molekuläre Phylogenetik untersucht die hierarchischen evolutionären Beziehungen zwischen Organismen mittels molekularer Daten. Diese Beziehungen werden typischerweise durch einen gewichteten Baum, der als Phylogenie genannt, beschrieben, deren Blätter die beobachteten Organismen darstellen, innere Scheitelpunkte, die intermediäre Vorfahren darstellen, und die Kanten repräsentieren evolutionäre Beziehungen zwischen den Paaren von Organismen. Hier sind einige wichtige Merkmale von "Phylokoko": · das GTR-Modell der DNA-Evolution. · Gamma-Distribution zum Modellieren der Heterogenität des Standorts. · Zufällige Richtungen, Brent-Algorithmus und zufällige Suche nach uneingeschränkter nichtlinearer Optimierung der Wahrscheinlichkeitsparameter. · Sehr große Nachbarschaftsbereich (VLSN) nach der Topologieoptimierung. Titeratierte lokale Suche (ILS), um den Lösungsraum zu erkunden. · Phylococo verwendet Paloalto, um die resultierenden Phylogenez-Anzeigen anzuzeigen. Empfohlen: · Ein Intel Core 2 Duo · Java 1.5 oder höher. Was ist neu in dieser Version: · Verbessert Geschwindigkeit und Stabilität der gesamten grafischen Anwendung · Unterstützt FIGTREE 1.2.1

Phylokoko. Zugehörige Software