Paretis
Kostenloses Werkzeug für parallele Graphenpartitionierung und füllreduzierende Matrixbestellung ...
5 MB
 | Palma.mRNA mit Genomausrichtungen mit großen Margor-Algorithmen |
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Palma. Ranking & Zusammenfassung
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- Lizenz:
- GPL
- Preis:
- FREE
- Name des Herausgebers:
- Friedrich Miescher Laboratory
- Website des Verlags:
- http://www.fml.tuebingen.mpg.de/fml
- Betriebssysteme:
- Mac OS X
- Dateigröße:
- 4.4 MB
Palma. Stichworte
Palma. Beschreibung
mRNA mit Genomausrichtungen mit großen Randalgorithmen Palma richtet zwei genomische Sequenzen optimal aus, je nach dem zugrunde liegenden Algorithmus und ausgebildeten Parametern. Das Haupt-Python-Skript nimmt zwei FASTA-Dateien auf, die das Ziel enthalten (z. B. eine DNA-Sequenz, ein Teil des Genoms) und Abfragesequenzen (z. B. eine cDNA- oder EST-Sequenz). Palma erstellt eine Ausrichtung mit dynamischer Programmierung (in C ++ geschrieben) und gibt die Ausrichtung in einem PSL-Format zurück. Die Algorithmen werden diejenigen sein, die optimale lokale Ausrichtungen berechnen werden, also, wenn keine Ausrichtung gefunden wurde, liegt an, dass keine Ausrichtung eine ausreichend hohe Ausrichtungsergebnisse erhielt. Anforderungen: · Shogun. · Python
Palma. Zugehörige Software
