Msplicer

-Tool zur Verbesserung der C. Elegans Genome Annotation mit Maschinenlernen
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Msplicer Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Lizenz:
  • GPL
  • Preis:
  • FREE
  • Name des Herausgebers:
  • Friedrich Miescher Laboratory
  • Website des Verlags:
  • http://www.fml.tuebingen.mpg.de/fml
  • Betriebssysteme:
  • Mac OS X
  • Dateigröße:
  • 18 KB

Msplicer Stichworte


Msplicer Beschreibung

Werkzeug zur Verbesserung der C. Elegans Genome Anmerkung mit Machine Lernen Das Training des MSPlicer-Tools beinhaltet die Lösung eines relativ großen Linearoptimierungsproblems, das in MATLAB mit dem CPLEX-Optimierungspaket implementiert ist. MSPlicer basiert auf Python-Skripts, die in C ++ implementiert sind, um Spleißstellen mithilfe von Support-Vektormaschinen und dynamischer Programmierung für die Spleißformvorhersage vorherzusagen. Diese Routinen sind Teil der frei verfügbaren Shogun Toolbox für das Kernel-Lernen mit großem Maßstab. Anforderungen: · Shogun 0.6.2 oder höher · Python


Msplicer Zugehörige Software

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273 5 MB

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