| MsatCommander. Diese Anwendungsquellenanwendung dabei hilft Ihnen, MicroSatellite-Wiederholungen, Designort-spezifische Primer zu lokalisieren und zu kennzeichnen |
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MsatCommander. Ranking & Zusammenfassung
- Name des Herausgebers:
- Brant C. Faircloth
- Website des Verlags:
- http://code.google.com/u/faircloth/
- Betriebssysteme:
- Mac OS X 10.4 or later
MsatCommander. Stichworte
MsatCommander. Beschreibung
Diese Antrag auf Open Source hilft Ihnen, MicroSatellite-Wiederholungen, Designort-spezifische Primer zu lokalisieren und sie zu kennzeichnen MSATCOMMAND ist ein Python-Programm, das geschrieben wurde, um MicroSatellite (SSR, VNTR, C) zu lokalisieren (SSR, VNTR, C) wiederholt sich in Fasta-formatierten Sequenz- oder Konsensdateien. MSATFinder sucht nach allen Di-, Tri-, Tetra-, Penta- und Hexa-Nucleotid-Wiederholungen (mit Optionen, um nach weniger Wiederholtypen und Kombinationen von Wiederholungsarten zu suchen) .msatcommander tagelt und entwerfen auch Primer mit Primer3 als Grundierung Design-Motor. Hier sind einige wichtige Funktionen von "msatcommander": · Sucht nach allen Mono-, Di-, Tri-, Tetra-, Penta- und Hexanukleotid-Wiederholungen · Wiederholungen können über benutzerdefinierte Entfernungen (BP) kombiniert werden. · Entwirfte Primer für das Gelegenheiten wiederholt · Tags und Tests Primer mit M13R, CAG oder Custom-Tag. Der 'beste' Primer wird dem Benutzer gemeldet · Bietet eine komfortable GUI für die Mehrheit der Benutzer · Ausgänge Ergebnisse im CSV-Format, für die einfache Importation in die Tabellenkalkulationssoftware
MsatCommander. Zugehörige Software