 | Mac5.ein Programm für phylogenetische Rekonstruktion mit gepapften Daten |
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Mac5. Ranking & Zusammenfassung
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- Lizenz:
- Freeware
- Preis:
- FREE
- Name des Herausgebers:
- Paul-Michael Agapow
- Website des Verlags:
- http://www.agapow.net/software/rst2beamer
- Betriebssysteme:
- Mac OS X
- Dateigröße:
- 496 KB
Mac5. Stichworte
Mac5. Beschreibung
Ein Programm für die phylogenetische Rekonstruktion mit gepackten Daten MAC5 ist ein Programm, das die MCMC-Probenahme implementiert, um einen phylogenetischen Baum von einer DNA-Mehrfachausrichtung schätzen zu können. Was MAC5 aus ähnlichen Programmen unterscheidet (z. B. Bambe, MRBayes) ist deren Verwendung von Fünfzustands-Sequenz-Evolution-Modelle als Mittel, um die Lückeninformationen bei der Abschätzung einer Ausrichtung aufzunehmen. Trotz der Verschwörung dieser Modelle in der Literatur in der Vergangenheit (z. B. Durbin et al., 1998, S. 217), wurde festgestellt, dass sie unter anderem nützlich sind, um die Präzision der Topologieschätzung zu verbessern.
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