| Evm kombiniert ab Intio-Genvorhersagen und Protein- und Transkriptionsausrichtungen in gewichtete Konsens-Gen-Strukturen |
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Evm Ranking & Zusammenfassung
- Name des Herausgebers:
- Brian Haas
- Betriebssysteme:
- Mac OS X
Evm Stichworte
Evm Beschreibung
Kombiniert AB Intio-Gen-Vorhersagen und Protein- und Transkriptionsausrichtungen in gewichtete Konsens-Gen-Strukturen Die Software von EvidenCemModeler (AKA EVM) kombiniert AB Intio-Gen-Vorhersagen und Protein- und Transkriptionsausrichtungen in gewichtete Konsens-Gen-Strukturen. EVM bietet einen flexiblen und intuitiven Rahmen für die Kombination von diversen Nachweisstypen in ein einzigartiges Annotationssystem der automatisierten Genstruktur. Die EVIDENCEMODELER-Software wird wie Komponente der eukaryotischen automatisierten Genstruktur-Annotationspipeline verwendet, die am Institut für genomische Forschung verwendet werden. In Evm sind die Genomsequenz, Genvorstellungen und Ausrichtungsdaten in das GFF3-Format einzuschließen, und eine Liste von numerischen Gewichtswerten, die anzuwenden sind zu jeder Art von Beweismitteln. Die Gewichte können manuell konfiguriert oder für eine optimale Leistung mit der inklusive der Trainingsoftware ausgebildet sein. Was ist neu in dieser Version: · Simple_example mit runme.sh hinzugefügt, um EVM auf einem kleinen Beispiel-Datensatz zu demonstrieren. Ein GFF3-Parsing-Glitch behoben, um die Analyse von Ausrichtungsdaten verbessert zu haben.
Evm Zugehörige Software