Pyvox Pyvox ist ein Satz von Softwaretools für die medizinische Bildverarbeitung.
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Pyvox Beschreibung

Pyvox ist ein Satz von Softwaretools für die medizinische Bildverarbeitung. Pyvox ist ein Satz von Softwaretools für die medizinische Bildverarbeitung, insbesondere ein Schädelabzug und Segmentierung von MR-Gehirnbildern; Tools zur Unterstützung anderer Anwendungen können später hinzugefügt werden. Diese Tools sollen Forscher unterstützen, die neue Bildanalyse-Algorithmen prototypieren müssen, oder um automatisierte Bildanalyse-Tools für bestimmte Bildanalyseanwendungen zu entwickeln. Die Reihenfolge der Verarbeitungsvorgänge wird über die Skriptsprache Python angegeben, die interaktiv oder in Befehlsdateien verwendet werden kann; Die Kernbildverarbeitungsalgorithmen werden in c geschrieben, um eine effiziente Verarbeitung von Volume-Images zu verarbeiten. Importanten Designkriterien für PYVOX umfassen: Skriptdateien und Datendateien sind über mehrere UNIX-Plattformen, einschließlich Linux und Mac OS X, tragbar. Geeignet für das schnelle Prototyping neuer Algorithmen und Analyseprotokolle; geeignet für eine effiziente automatisierte Verarbeitung der fertigen Analyseprotokolle; Durch die Programmierer außerhalb des Originalentwicklungsteams.PyVOX wird auf eine offene Quelllizenz ausgeschlossen Pyvox ist in erster Linie für die medizinische Bildverarbeitung konzipiert, da der Autor am meisten tun muss; Andere Anwendungen von Volumenbildern sind zweifellos möglich, aber ihre Bedürfnisse kommen zweiters.RAPID PROTOTYPING · Pyvox sollte für ein schnelles Prototyping neuer Algorithmen und Analyseprotokolle geeignet sein. Dazu wird Pyvox als Erweiterung der Python-Sprache umgesetzt. Python ist eine objektorientierte Skriptsprache mit hoher Ebene, die interaktiv oder in programmierten Skripts verwendet werden kann und der in c. equiquenter Ausführung leicht dehnbar ausgebildet ist · Pyvox sollte auch für eine effiziente, automatisierte Verarbeitung der fertigen Analyseprotokolle geeignet sein. Dazu werden die Kernbildverarbeitungsfunktionen in c geschrieben, was effizienter ist als python.software-Portabilität · Die Skriptdateien, die die Analyseprotokolle definieren, und die von ihnen aufgeforderten Programme, die sie aufrufen, sollten über mehrere UNIX-Plattformen (einschließlich Linux und Mac) tragbar sein. OS X). Um diese Anforderung zu erfüllen, wird Pyvox geschrieben, um den üblichen Standards einzuhalten, einschließlich ANSI C, POSIX und X Window System.Data-Portabilität · Die Bilddateien und andere Datendateien sollten auch über mehrere UNIX-Plattformen tragbar sein. Insbesondere sollte es möglich sein, eine Bilddatei auf einer Big-Endian-Maschine (z. B. SPARC) zu erstellen, sie an ein kleines Endanamer (z. B. Pentium) zu kopieren und dieses Bild weiter zu verarbeiten, ohne die Konvertierung der Datei durchführen zu müssen . Dies wird durch eine Reihe von tragbaren C-Funktionen erfüllt, die Daten in angegebenen externen Formaten lesen und schriftlich schreibt, nach Bedarf an oder von der Plattform-nativen Format umgewandelt. Team. Dies wird durch folgende gute Software-Engineering-Praxis, um die Software für spätere Wartung und Erweiterungen zu dokumentieren. An den richtigen Stellen installiert, die Befehlssequenz ./configure Machen Sie REGRESS REGRESS installieren, indem sie in der Regel kompilieren, Regressionstest und installieren Sie Pyvox. Wenn dies nicht funktioniert, finden Sie in der Installation Kapitel des PYVOX-Referenzhandbuchs (doc / pyvox.pdf oder doc / pyvox.tex) für ein detailliertes Installationsvorgang. Was neu in dieser Version ist: · Die Schnittstelle zum Erstellen von Faltungskern Komplett neu gestaltet und unterstützt nun die dynamische Änderung von Kernel. · Innentypen haben jetzt MIN- und MAX-Attribute, die die minimalen und maximal möglichen endlichen positiven Werte enthalten, die in diesem Typ darstellbar sind.

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