Microarray Explorer. Microarray Explorer (MAEXPLORER) ist eine Java-basierte Data-Mining-Einrichtung für cDNA- oder Oligonucleiotide-Microarray-Datenbanken.
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Microarray Explorer. Ranking & Zusammenfassung

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Microarray Explorer. Beschreibung

Microarray Explorer (MAEXPLORER) ist eine Java-basierte Daten-Mining-Fazilität für cDNA- oder Oligonucleiotide-Microarray-Datenbanken. Microarray Explorer (MAEXPLORER) ist eine Java-basierte Daten-Mining-Fazilität für cDNA- oder Oligonucleiotide-Microarray-Datenbanken. Die Umgebungsumgebung der Erkundungsdatenanalyse bietet Werkzeuge für den Datenabbau von quantitativen Expressionsprofilen über mehrere Microarrays.MicroArray-Daten können in Array-Pseudoimages, Scatter-Parzellen, Histogramme, Expressionsprofil-Parzellen, Clusteranalysen (ähnliche Gene, k-Mittel, direkt angesehen und direkt manipuliert werden oder K-Median, hierarchisches Clustering usw.) und Berichte. Ein wichtiges Merkmal ist die GEN-Datenfilter zum Einschränken eines Arbeitssatzes von Genen an diejenigen, die eine Vielzahl von benutzerfördernden Tests und -bedingungen bestehen. Berichte können mit Hypertext-Webzugriff auf genomische Datenbanken wie Uniche, Genbank, DBEST, Locuslink, Image, NCI / CIT MIDB Microarray-Datenbank und andere Internet-Datenbanken für Sets von Genen, die von Interesse festgestellt wurden. Es ist der Hauptfokus dieses Tools Interaktiver Datenbergbau mit Zugriff auf andere unterstützende Web-Genom-Datenbanken. Der Schwerpunkt auf die direkte Manipulation von Genen und GENE-Sets in Grafiken und Tabellen bietet ein hohes Maß an Interaktion mit den Daten, die es den Ermittlern erleichtern, Ideen beim Auf der Suche nach Mustern zu testen. Hier sind einige wichtige Funktionen von "Microarray Explorer": · Analysen von Daten (nachdem Arrays gescannt wurden, und quantifizierte Flecken) · Umfasst mehrere cDNA- oder oligo-Array-Proben mit Replikationsflecken · Verwaltet die Replikate von Mustern, benannte Bedingungssätze von Mustern und Listen von Bedingungssätzen · Verwaltet den genannten Teilmengen von Genen · Griffe Intensität oder Verhältnis (CY3 / CY5) quantifizierte Array-Daten · Analysiert Daten für 2-Bedingungen und N-Bedingungs-Expressionsprofile, einschließlich der Anova auf eine beliebige Anzahl von Replikationsbedingungen · Datenfilter Gene-Sets nach Statistiken, Clustering, Gene-Set-Mitgliedschaft · Bietet Direktdatenmanipulation in Grafiken, Tabellenkalkulationen und Beispielverwaltung · Greift Genomic-Webserver von PLOTs und Berichten auf · Konvertiert Ihre Daten mit dem CVT2MAE-Datenkonvertierungs-Assistenten · Sowohl maexplorer als auch cvt2mae werden in Java für die Portabilität mit Download-Installationsinstallaten geschrieben, so dass es einfach auf jedem System ausgeführt wird · Benutzer können diese Programme einst aktualisieren, einst installiert, indem Sie nur die JAVA JAR-Dateien mithilfe von Update-Befehlen herunterladen.

Microarray Explorer. Zugehörige Software