Transposonpsi.
Transpoonpsi ist ein Analysewerkzeug, um Protein- oder Nukleinsäuresequenz-Homologie zu identifizieren. ...
 | LuteFiskxp.LuteFiskxp ist eine ANSI C-kompatible Software, die zur Durchführung der neuen Peptidsequenzierung von Tandem-Massenspektren verwendet wird. |
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LuteFiskxp. Ranking & Zusammenfassung
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- Lizenz:
- GPL
- Preis:
- FREE
- Name des Herausgebers:
- Richard S. Johnson
- Website des Verlags:
- http://www.hairyfatguy.com/lutefisk/
LuteFiskxp. Stichworte
LuteFiskxp. Beschreibung
LuteFiskxp ist eine Ansi C-kompatible Software, die zur Durchführung der neuen Peptidsequenzierung von Tandem-Massenspektren verwendet wird. LuteFiskxp ist eine Ansi C-kompatible Software, die zur Durchführung der neuen Peptidsequenzierung von Tandem-Massenspektren verwendet wird. LuteFisk ist Software für die De-Novo-Interpretation von Peptid-CID-Spektren. Hohe Qualität Tandem-Massenspektren von Peptiden werden häufig erhalten, für die keine genaue Datenbankübereinstimmung gemacht werden kann B. unterschiedliche Variation, Datenbanksequenzfehler oder unerwartete proteolytische Spaltungen. Um mit dem Ansprache dieses Problems zu beginnen, führen wir mit dem Computerprogramm LuteFisk eine De-Nounderpretation der CID-Spektren durch; Alle solchen Interpretationen ergeben jedoch fast immer mehrere Sequenzkandidaten, wo es oft schwierig oder unmöglich ist, die richtige Sequenz von den falschen zu unterscheiden. Die Variationen zwischen Kandidatensequenzen sind oft geringfügig und umfassen typischerweise Dipeptideinversionen, das Tauschen von Dipeptiden derselben Masse , Ersatz von Dipeptiden mit einzelnen Aminosäuren derselben Masse und Ersetzungen von Aminosäuren durch Dipeptide derselben Masse. Wir verwenden die mehreren Sequenzkandidaten, die von LuteFisk als Abfragesequenzen in einem zweiten Programm erzeugt werden. Cidididify ist eine Version von Bill Pearsons FASTA-Algorithmus, das von Alex Taylor modifiziert wurde, um MS-Nuancen wie mehreren Abfragen, mehrdeutige Dipeptide und isobarische Massen-Äquivalenz.-.-.Prilieren, die auf UnixaNer ordnen Verwenden Sie den Befehl "LuteFisk" verwenden Params-Dateipfadname -R = Rückstände Dateipfadname -s = Pathnane der Datei mit Datenbanksequenzen zum Score -V = BEBOSE-Modus On (Standard OFF) -H = Drucken Sie diese HilfetextWas neu in dieser Version: · Aktualisiert Makefile
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