Estminer

ESTMINE ist ein Webanwendungs- und Datenbankschema für den interaktiven Bergbau von exprimiertem Sequenz-Tag (EST).
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Estminer Beschreibung

EstMiner ist ein Webanwendungs- und Datenbankschema für den interaktiven Bergbau des exprimierten Sequenz-Tags (EST). ESTMINE ist ein Webanwendungs- und Datenbankschema für den interaktiven Bergbau von exprimierten Sequenz-Tag (EST) CONSTIG- und Cluster-Datensätze.Das Web-Interface enthält einen Abfragerahmen, der die Auswahl der CONTIGS / Cluster mit spezifischem CDNA-Bibliothek-Make-up oder Schwellenwert von Mitgliedern mit CDNA-Bibliothek ermöglicht Die Ergebnisse, die als farbkodierte Baumknoten angezeigt werden, in denen die Farbe die fraktionale Größe jeder cDNA-Bibliothekskomponente anzeigt. Die Knoten sind erweiterbar, die Bibliotheksstatistiken sowie EST- oder CONTIG-Mitglieder mit Links enthüllen, die für Sequenzdaten, Genbank-Datensätze oder andere Benutzer konfigurierbare Links konfiguriert werden können. Die Schnittstelle ermöglicht auch "Abfragen in Abfragen", in denen der Ergebnissatz einer Abfrage von der nachfolgenden Abfrage weiter filtriert wird. Anforderungen: · Jakarta Tomcat 5.0.19 oder höher · MySQL 4.0.17 oder höher / Oracle 9.0 oder höher


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