Chemie :: Datei :: pdb Protein Data Bank File Format Reader / Writer
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Chemie :: Datei :: pdb Beschreibung

Protein Data Bank File Format Reader / Writer Chemie :: Datei :: PDB ist ein Perl-Modul, das PDB-Dateien liest und schreibt. Das PDB-Dateiformat wird üblicherweise zur Beschreibung von Proteinen verwendet, insbesondere diejenigen, die in der Proteindatenbank gespeichert sind (http://www.rcsb.org/pdb/). Die aktuelle Version dieses Moduls liest nur die folgenden Datensatztypen, ignoriert alles andere: Atom Hetatm Endmdl Endthis-Modul registriert automatisch das 'PDB'-Format mit Chemie :: MOL, sodass PDB-Dateien von der Chemie :: mol- > Lesen (). Bei Autodetektion Purpusses geht davon aus, dass Dateien in .pdb enden oder mit einer Zeile übereinstimmen / ^ (Atom | HETATM) / sind PDB-Dateien. Der PDB-Reader und der Schriftsteller ist für den Umgang mit Chemie :: Macromol-Objekte konzipiert, kann aber auch erstellen und verwenden Sie Chemie :: Mol-Objekte, indem Sie einige Informationen werfen. Synopsis verwenden Chemie :: Datei :: PDB; # Lesen Sie eine PDB-Datei Meine $ macro_mol = Chemie :: Macromol-> Lesen ("myfile.pdb"); # Schreiben Sie eine PDB-Datei $ macro_mol-> schreiben ("out.pdb"); # Lesen Sie alle Modelle in einer Multi-Model-Datei Meine @mols = Chemie :: Macromol-> Lesen ("Models.pdb"); # Lesen Sie ein Modell in einer Zeit, in der meine $ datei = chemie :: macromol-> file ("modell.pdb"); $ Datei-> offen; Während (meine $ mol = $ file-> read_mol ($ file-> fh)) {# Tun Sie etwas mit $ MOL} Anforderungen: · Perl.

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