Brabosphäre

Brabosphäre ist ein OpenSource-Programm für die 3D-Visualisierung von molekularen Systemen und ihrer Eigenschaften.
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Brabosphäre Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Lizenz:
  • GPL
  • Preis:
  • FREE
  • Name des Herausgebers:
  • Ben Swerts
  • Website des Verlags:
  • http://www.brabosphere.be/

Brabosphäre Stichworte


Brabosphäre Beschreibung

Die Brabosphäre ist ein OpenSource-Programm für die 3D-Visualisierung molekularer Systeme und ihre Eigenschaften. Die Brabosphäre ist ein OpenSource-Programm für die 3D-Visualisierung molekularer Systeme und ihre Eigenschaften. Der Name der Brabosphäre stammt aus dem quantenmechanischen Programmpaket BRABO (entwickelt in der Gruppe der Strukturchemie der Universität von Antwerpen), für die er als grafisches Frontend fungiert. Es kann auch für die Analyse und Visualisierung der aus diesem Typ ergebenen Daten verwendet werden Berechnungen. In dieser Hinsicht werden auch Ergebnisse aus einigen anderen quantenmechanischen Anwendungen akzeptiert. Für die schnelle Ansicht von molekularen Strukturen wird das Programm CrdView entwickelt, das als Ersatz für Xmol wirkt und die Befehlszeilenumwandlung zwischen einer Vielzahl von Koordinaten-Dateiformaten ermöglicht. Hier sind einige wichtige Merkmale von "Brabosphäre": Molekülbauer: · Atome können mit absoluten oder relativen kartesischen Koordinaten und internen Koordinaten hinzugefügt und positioniert werden. · Sie können natürlich auch gelöscht werden · Atome oder Atomegruppen können mit Maus / Tastatur verschoben werden oder die genauen Werte angeben. · Atomegruppen können um ihr Massenmittelpunkt gedreht werden. · Bindungen, Valenzwinkel und Torsionswinkel können mit der Maus / Tastatur geändert werden. Die Berechnung von Torsionspotenzialen war noch nie einfacher! Die folgenden Eigenschaften können in den 3D-Fenstern visualisiert werden: · Elementtyp und Index · Mulliken- oder Aktioniergebühren · Atomkräfte · Eine unbegrenzte Anzahl von Isosurfaces 3D-Dichte mit verschiedenen Farben und Transparenzeinstellungen · Berechnungen werden im chemischen Format Chemical Markup Language (CML), dem XML-basierten Chemieformat der Zukunft, gespeichert. Die folgenden Arten von Brabo-Berechnungen können eingerichtet werden: · Einzelne Punktenergie · Energie und Kräfte · Geometrieoptimierung. · Die Berechnungseinstellungen können extrem detailliert mit einer Schnittstelle geändert werden, die den Zusatz neuer Keywords und Optionen ermöglicht. Generierte Eingabedateien können vor der Ausführung überprüft werden. · Eine einfache Schnittstelle ist vorhanden, um alle von einer Berechnung erstellten Ausgabedateien anzuzeigen. · 2D-Elektronendichte-Map-Dateien, die von BRABO's Potdicht-Programm erstellt wurden, können auf verschiedene Weise in hoher Qualität visualisiert werden. Regionen können in der Dichte für Extreme analysiert werden. · 3D-Wasserstoff-ähnliche Orbitale können analytisch für alle Elemente berechnet und mit Isodensitäten und Scatter-Parzellen visualisiert werden. · MDI: Brabosphäre kann eine unbegrenzte Anzahl von Berechnungen eröffnen und in der nativen Mehrfachdokumentschnittstelle jeder Plattform präsentieren. Man kann zwischen dem Windows MDI-Modus, dem UNIX-Toplevel-Modus und dem TABSPage-Modus, wechseln, auch wenn die Anwendung ausgeführt wird. Anforderungen: · Qt. · Öffnen Sie BABEL.


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