Bioperl A Perl-Erweiterungen für Bioinformatik.
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Perl Erweiterungen Bioperl Perl-Erweiterungen.

Bioperl Beschreibung

Eine Perl-Erweiterung für Bioinformatik. BIOPERL-Projekt ist eine Sammlung von Perl-Modulen, die die Entwicklung von Perl-Skripten für Bioinformatik-Anwendungen erleichtern. Daher enthält es nicht bereit, Programme in dem Sinne zu verwenden, in dem viele kommerzielle Pakete und kostenlose webbasierte Schnittstellen (z. B. Entrez, SRS) do (z. B. Entrez, SRS). Daraufhin liefert BIOperl wiederverwendbare Perl-Module, die das Schreiben von Perl-Skripts für die Reihenfolge erleichtern Manipulation, Zugriff auf Datenbanken mit einer Reihe von Datenformaten und Durchführung und Analyse der Ergebnisse verschiedener Molekularbiologie-Programme, einschließlich Explosion, Clustalw, Tcoffee, Genscan, Estscan und HMMER. Folglich ermöglicht BIOperl die Entwicklung von Skripts, die große Mengen von Sequenzdaten auf eine Weise analysieren können, die in der Regel schwierig oder unmöglich mit webbasierten Systemen sind. In der Reihenfolge von BIOPERL nutzen, benötigt der Benutzer ein grundlegendes Verständnis der Perl-Programmiersprache, einschließlich eines Verständnisses von So verwenden Sie Perl-Referenzen, Module, Objekte und Methoden. Wenn diese Konzepte ungewohnt sind, wird der Benutzer auf eine der verschiedenen Einführungs- oder Zwischenbücher auf Perl.Wire gefallen. Dieses Tutorial soll den Grundlagen der Perl nicht mit wenig oder keiner Erfahrung in der Perlsprache unterrichten. Andererseits ist ein fortgeschrittenes Wissen über Perl - z. B. wie ein Objektorientierter Perl-Modul - nicht erfolgreich mit bioperl.bioperl-Software erforderlich ist, ist Open Source-Software, die sich noch unter aktiven Entwicklung befindet. Die Vorteile der Open Source-Software sind allgemein bekannt. Dazu gehören die Fähigkeit, den Quellcode und die Befreiung von Softwarelizenzgebühren frei zu prüfen und zu ändern. Da die Open-Source-Software in der Regel von einer großen Anzahl von freiwilligen Programmierern entwickelt wird, ist der resultierende Code oft nicht so klar organisiert und seine Benutzeroberfläche nicht als Standardisiert wie in einem ausgereiften kommerziellen Produkt. In jedem Projekt unter aktiven Entwicklung kann die Dokumentation nicht mit der Entwicklung neuer Funktionen mithalten. Folglich ist die Lernkurve für aktiv entwickelte Open-Source-Quellsoftware manchmal steil. Anforderungen: · Perl. Was ist neu in dieser Version: · Dies ist die erste Kernfreigabe in der 1.6-Serie und die erste stabile Freigabe nach 5 Jahren Entwicklung.

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