| Biomaj. BIOMAJ (Biologie Mises A Jour) ist eine Workflow-Engine, die dem biologischen Datenbankmanagement gewidmet ist. |
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Biomaj. Ranking & Zusammenfassung
- Name des Herausgebers:
- BioMAJ
- Website des Verlags:
- http://biomaj.genouest.org/
Biomaj. Stichworte
Biomaj. Beschreibung
Biomaj (Biologie Mises A Jour) ist eine Workflow-Engine, die dem biologischen Datenbankmanagement gewidmet ist. Biomaj (Biologie Mises A Jour) ist eine Workflow-Engine, die dem biologischen Datenbankmanagement gewidmet ist. Die Biomaj-Software automatisiert den Aktualisierungszyklus und die Überwachung des lokal gespiegelten Datenbank-Repositorys.biologisches Wissen in einem genomischen oder postgenomen Kontext basiert hauptsächlich auf der transitiven Bioinformatik-Analyse, die in einem iterativen und periodischen Vergleich von Daten, die sich neu erstellt, gegen Korpus bekannter Informationen hergestellt. In Großbuchstabe benötigt dieser Ansatz eine genaue Bioinformatik-Software, Pipelines, Schnittstellen und zahlreiche heterogene biologische Banken, die auf der ganzen Welt verteilt sind. Ein Integrationsprozess, der in der Spiegelung und Indexierung dieser Daten besteht, ist offensichtlich ein wesentlicher Vorbereitungsschritt, der in den meisten Bioinformatik-Projekten eine große Herausforderung und Engpass darstellt; BIOMAJ soll dieses Problem beheben, indem ein flexibles und robustes vollautomatisches Umfeld vorgeschlagen wird. Hier sind einige wichtige Funktionen von "BIOMAJ": Synchronisation: · Mehrere Remote-Protokoll (FTP, HTTP, Rsync, lokale Kopie) · Leistungsstarke Ausnahmeabwicklung · Datenübertragungen Integritätsprüfung · Versionsversionierung unter Verwendung eines inkrementellen Ansatzes · Multi-Threading · Datenstrukturverzeichnis Normalisierung Postverarbeitung: · Erweiterte Workflow-Beschreibung (DAG) mit einfach normalisierter Syntaxsprache · Nach-Prozess-Indexierung für verschiedene Bioinformatik-Software (Blast, SRS, Fastacmd, ReseSeq, etc ...); · Einfache Integration von persönlichen Skripts für die Bank nach der Bearbeitung Lagerbestandteile.
Biomaj. Zugehörige Software