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BIO :: SEQIO :: FASTA Ranking & Zusammenfassung
- Lizenz:
- Perl Artistic License
- Name des Herausgebers:
- Ewan Birney & Lincoln Stein
- Website des Verlags:
- http://search.cpan.org/~birney/bioperl-1.4/Bio/SeqIO/fasta.pm
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BIO :: SEQIO :: FASTA Beschreibung
BIO :: SEQIO :: FASTA ist ein Perl-Modul mit FASTA-Sequenz-Ein- / Ausgabestrom. BIO :: SEQIO :: FASTA ist ein Perl-Modul mit FASTA-Sequenz-Ein- / Ausgabestrom.AppendixDie Rest der Dokumentationsdaten jeder der Objektmethoden. Interne Methoden sind in der Regel einem _Next_Seq-Titel vorangestellt: NEXT_SEQ Usage: $ SEQ = $ STROMS-> NEXT_SEQ () Funktion: Gibt die nächste Reihenfolge in der Stream-Rückgabe an: BIO :: SEQ-Objekt-Args: Nennrite_Seq-Titel: Write_Seq-Verwendung: $ Stream- > WRITE_SEQ (@Seq) Funktion: Schreibt das $ SEQ-Objekt in den Stream-Renditen: 1 für Erfolg und 0 für Fehler Args: Array von 1 bis N Bio :: PrimarySeqi ObjectWidth Titel: Breite Verwendung: $ obj-> breite ($ newval ) Funktion: Holen Sie sich die Zeilenbreite für FASTA-Ausgaberrückgabe: Wert der Breite Args: NEWVALUE (optional) Preferred_ID_TYPE-Titel: Preferred_ID_TYPE-Nutzung: $ obj-> Bevorzugt_ID_TYPE ('Beitritt') Funktion: Lassen Sie den bevorzugten Typ der Bezeichnung an Verwenden Sie in der Position "> ID" für den FASTA-Ausgang. Returns: String, einer der Werte, die in @BIO :: SEQIO :: FASTA :: SEQ_ID_TYPES definiert sind. Standard = $ BIO :: SEQIO :: FASTA :: Default_Seq_ID_TYPE ('Display'). Args: String beim Einstellen. Dies muss einer der Werte sein, das in @BIO :: SEQIO :: FASTA :: SEQ_ID_TYPES definiert ist. Zulässige Werte: Beitritt, Zugangsdauer, Anzeige, Primärwürfe: Fatale Ausnahme, wenn der mitgelieferte ID-Typ nicht in @Seq_ID_TYPES ist. Anforderungen: · Perl.
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