Annotathon. Bioinformatik-Training durch metagentomische Sequenz Annotation.
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Annotathon. Ranking & Zusammenfassung

Annotathon. Stichworte

Kurs Ausbildung Bioinformatik Bioinformatikkurs. Bioinformatik-Training.

Annotathon. Beschreibung

Bioinformatik-Training durch metagentomische Sequenz Annotation. Annotathon ist ein Internet-Unterrichtsumfeld für Universitätsstudenten, um einem grundlegenden Bioinformatikkurs zu folgen. Ein Online-Server, der das Annotathon implementiert, ist verfügbar unter: http://annotathon.univ-mrs.fr/we hat die zunehmende Menge an metagentenomischen Daten in Anspruch genommen, um eine Unterrichtsumgebung zu entwickeln, in der die Studierenden die Gelegenheit gegeben werden, " Daten in Wissen umschalten ". Annotathon genannt, diese Internet-Unterrichts-Plattform fördert Teamarbeit und Führungen, die Annotatoren von Lehrmitteln durch jeden Schritt in Silico-Analysen, von der ORF-Identifikation bis hin zur funktionsfähigen und phylogenetischen Klassifizierung auslassen. Die Erzeugung von Rohergebnissen ist ein wesentlicher Bestandteil der Übung, aber starker Schwerpunkt wird auf ihre Interpretation und kritische Beurteilung gesetzt. Das Online-Format eignet sich ideal für die Beteiligung der studentischen Beteiligung außerhalb der Klasse, während Instructors die Annotatoren mit kontinuierlichem Feedback liefern. Ein iterativer Bewertungszyklus ermöglicht es den Schülern, auf konstruktive Kritik zu reagieren und verbesserte Versionen ihrer Anmerkungen zu erzeugen. Eine Studentenausfahrt-Umfrage zeigt, dass, obwohl die Herausforderung, dass das Studium der bisher nicht kommentierten Sequenzen ein großer Anreiz für 75% der Teilnehmer ist. Der Erfolg dieses Ansatzes stützt sich auf folgende Angaben: i) Lernen durch Tune: Bioinformatik wird am besten von First-Hand-Erlebnis eingeführt. Theoretische Überlegungen sind leichter zu erfassen, sobald Sie mit den Werkzeugen vertraut sind "Twilight Zone" Ähnlichkeiten oder "Müll in, Müll aus" phylogenetische Tree Reconructions.III) Lernen aus konstruktiver Kritik Drei Jahre, Analyse von insgesamt 2,3 MB mikrobiellen DNA von 2,3 MB, die 9500 Stunden kumulative Annotation darstellen. Interessanterweise stimmen studentische handgefertigte Anmerkungen mit den von automatischen Annotationspipelines erzielten Annotationen einverstanden. Basierend auf diesen Beobachtungen nennen wir unsere Kollegen, um in Betracht ziehen, einer Initiative, um ein weltweites "Gitter von Bachelor-Annotatoren" zu schaffen. Da mehr Teams teilnehmen, könnte dies zu einer lehrenden Annotationsgemeinschaft mit Raum für wissenschaftliche Beitrag führen. Die Open Source Online Annotathon-Umgebung (http://annotathon.univ-mrs.fr) wird als Grundlage für diese kollaborative Initiative angeboten. Anforderungen: · PHP. · MySQL.

Annotathon. Zugehörige Software