Aipotu

Früher der molekulare Genetik-Explorer
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Aipotu Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Lizenz:
  • Freeware
  • Preis:
  • FREE
  • Name des Herausgebers:
  • Brian White and Ethan Bolker
  • Website des Verlags:
  • http://umb.edu/

Aipotu Stichworte


Aipotu Beschreibung

Das ehemalige Molecular Genetics Explorer Aipotu ist eine Software, die eine Utopie erzeugt, die die Genetik simuliert, Biochemie, Molekularbiologie und Evolution der Organismen in einem biologisch sinnvoll und pädagogisch relevanten way.This Software war früher die Molecular Genetics Explorer genannt; es wird mit der Zugabe einer Evolution Workspace.Aipotu verbessert ist eine BioQuest Software-Simulation, die integriert Genetik, Biochemie, Molekularbiologie, und die Entwicklung ein biologisches Phänomen zu untersuchen. Es soll die Studierenden die Verbindungen zwischen diesen drei Schlüsseldisziplinen der modernen Molekulargenetik zu zeigen. Es basiert auf Botstein Dreieck .Mit des Genetik-Tool können Sie: * Cross zwei Organismen von zwei Organismen aus dem Gewächshaus Auswahl und / oder von jeder Arbeitsplatte und Kreuz Zwei Organismen klicken. Die resultierenden Organismen werden dann in einem Arbeitsfeld erscheinen in und ein Eintrag in der History-Liste hinzugefügt werden. * Selbstquer eines Organismus durch einen Organismus aus dem Gewächshaus oder von beide Arbeitsplatte auswählen und Selbstkreuz Eines Organismus klicken. Die resultierenden Organismen werden dann in einem Arbeitsfeld erscheinen in und ein Eintrag in der History-Liste hinzugefügt werden. * Erstellen mutierte Versionen eines Organismus durch Auswahl eines Organismus aus dem Gewächshaus oder von beiden Arbeitsplatte und Mutate Ein Organismus klicken. Die resultierenden Organismen werden dann in einem Arbeitsfeld erscheinen in und ein Eintrag in der History-Liste hinzugefügt werden. * Speicher zum Gewächshaus eines Organismus von einem Organismus aus dem Gewächshaus oder von beide Arbeitsplatte auswählen und auf Hinzufügen .... * die Ergebnisse eine Quer bringen usw. aus der Historienliste auf eine Arbeitsplatte mit einem Doppelklick auf die entsprechenden Artikel in der Historienliste und den entsprechenden Eintrag aus dem Menü auswählen, dass appears.With das Biochemie-Tool können Sie: * Blick auf den Strukturen und Farben der Pigmentproteine in einem Organismus gefunden durch einen Doppelklick auf den entsprechenden Organismus im Gewächshaus. * Design-Proteine und ihre Formen und Farben beobachten, indem die Ein-Buchstaben-Code für die gewünschten Aminosäuren in der Aminosäuresequenz Feld und klicken Sie auf die Schaltfläche Falten eingeben. Das resultierende gefaltete Protein wird in dem Klappfenster erscheinen und ein Eintrag in der History-Liste hinzugefügt werden. * Die Aminosäuresequenzen von verschiedenem Pigment Proteinen vergleichen, indem das entsprechende Element in dem Vergleich Menü auswählen. * Ein gefaltetes Protein aus der Verlaufsliste auf eine Arbeitsplatte Bringen Sie durch einen Doppelklick auf den entsprechenden Eintrag in der Verlaufsliste und den entsprechenden Eintrag aus dem Menü, dass appears.With der Molekularbiologie-Tool können Sie auswählen: * Blick auf der DNA, mRNA und Proteinsequenzen von Pigment-Protein-Gene in einem Organismus durch einen Doppelklick auf den entsprechenden Organismus im Gewächshaus gefunden. durch die Bearbeitung des oberen DNA-Strang in entweder des Gen Windows-Maschine und auf die Falten Protein-Taste * Design-Gene und die Farben der resultierenden Proteine beobachten. Die Farbe des resultierenden gefalteten Proteins wird angezeigt und ein Eintrag in die History-Liste hinzugefügt werden. * Die DNA-Sequenzen verschiedenen Pigment-Proteingen Vergleichen durch das entsprechende Element von dem Vergleich Menü auswählen. Durch eine Veränderung der DNA-Sequenzen, wie oben und auf Hinzufügen klicken * neue Organismen erstellen durch ihre DNA-Sequenzen spezifizieren .... * Bringen Sie ein Gen aus der Historienliste auf eine Arbeitsplatte mit einem Doppelklick auf den entsprechenden Eintrag in der History-Liste und Auswahl der entsprechenden Element aus dem Menü, dass appears.With die Evolution-Fenster können Sie: * Load Selected Organismen in die Welt, die sie im Gewächshaus, und klicken Sie auf die Schaltfläche laden auswählen. * Die relative Eignung von jeder Farbe ein, indem Sie Werte in den Relative Fitness Produkte entschieden haben. * Die Rate von Mutationen im Einstellungsfenster einstellen, können Sie die pro-Basisraten Punkt, Insertion und Deletionsmutationen wählen. * Eine Entwicklung ausgeführt starten indem Sie auf Start. Die Organismen in der Welt werden dann zu Mutation und Selektion unterworfen werden. * Siehe zählt jede Farbe in jeder Generation. * Die Simulation Pause durch die Pause-Taste klicken. Sie können die Simulation neu starten, wenn Sie möchten. * Speichern von ausgewählten Organismen in die Gewächshäuser für ein Studium in den anderen Abschnitten des Programms. * Speichern Sie alle Organismen in der Welt in eine Datei. Im Menü Datei speichert World-Datei auswählen .... Diese Datei wird von anderen Programmen analysiert werden kann, oder in AIPOTU für eine andere Entwicklung Lauf geladen. Anforderungen: · Java 2 Standard Edition Runtime-Umgebung Was ist neu in dieser Version: · Speichern unter ... Gewächshaus funktioniert nun richtig · Backbone-Spur in Biochemie ist jetzt sichtbarer · Rückkehrschlüssel nun falten Protein in der Biochemie und in der Molekularbiologie


Aipotu Zugehörige Software

Pysam

Python-Schnittstelle für das SAM / BAM-Sequenz-Ausrichtungs- und -ordingformat ...

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