Ugene.

Eine komplexe Genomanalyse-Suite
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Ugene. Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Lizenz:
  • GPL
  • Name des Herausgebers:
  • UniPro
  • Betriebssysteme:
  • Windows All
  • Dateigröße:
  • 12.2 MB

Ugene. Stichworte


Ugene. Beschreibung

UGENE ist eine umfassende Genomanalyse-Suite, die mehrere Sequenzausrichtungen und ein komplexer HMM-Builder und Suchmodul aufweist. UGENE ist ein praktisches Werkzeug, das auch ein visuelles und interaktives Genom-Browsing-Erlebnis bietet. Auch verfügbar: tragbar ugene Haupteigenschaften: Mehrere Sequenzausrichtung mit Muskeln 3 und Muskeln 4; Hmm-Profile bauen und suchen, basierend auf der Quelle von HMMER 2 und HMMER 3; PCR-Primer-Design mit Primer 3; -Protein-Sekundärstruktur-Vorhersage mit GOR IV und PSIPRED; Suche nach Restriktionsenzymen und Integration mit Rebase; Extrem schnell wiederholen Finder; Suchen Sie nach Transkriptionsfaktor-Bindungsstellen mit SiteCon; ORF Finder; Komplette Smith-Waterman-Algorithmus-Implementierung. Chromatogramme Visualisierung; 3D-Viewer für Dateien in PDB- und MMDB-Formaten; Multiple Sequenzausrichtungseditor; Einfach zu bedienender Workflow-Designer für benutzerdefinierte Computational Workflows. Vollständige Unterstützung moderner Multicore-Prozessoren und SSE-Anweisungen; aus der Box Unterstützung des modernen GPUs mit NVIDIA CUDA und ATI Stream; Integrierte Lösungen für den Zellbreitband-Motor; Private Lösungen für Supercomputer und verteiltes Computing.


Ugene. Zugehörige Software