GCUA: Allgemeine Codon-Nutzungsanalyse

Gene Analyse leicht gemacht.
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GCUA: Allgemeine Codon-Nutzungsanalyse Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Lizenz:
  • Freeware
  • Name des Herausgebers:
  • James O. McInerney
  • Betriebssysteme:
  • Windows All
  • Dateigröße:
  • 82 KB

GCUA: Allgemeine Codon-Nutzungsanalyse Stichworte


GCUA: Allgemeine Codon-Nutzungsanalyse Beschreibung

GCUA: Die allgemeine Codon-Nutzungsanalyse ist eine praktische, benutzerfreundliche, java-basierte Anwendung, die speziell für verschiedene Aufgaben ausgelegt ist, die zur Bewertung der Codon-Nutzung in einem Satz von Genen verwendet werden. Sie können es dazu bringen, einige einfache Dinge zu tun, um die Anzahl der Beobachtungen eines bestimmten Codons in einem Gen zu berechnen. Oder Sie können dasselbe für das kombinierte Dataset tun. Sie können auch Aminosäure-Nutzungsfrequenzen (erneut für jedes Gen oder für das Dataset als Ganzes) ansehen. Das Programm erzeugt auch eine Entfernungsmatrix basierend auf der Ähnlichkeit der Codon-Nutzung in Genen. Das wichtigste Merkmal des Programms ist jedoch die Fähigkeit, eine multivariate Analyse zu verwenden, um die Variation in der Codon-Nutzung zwischen Genen zu betrachten. Obwohl es populär ist, um zu sagen, dass ein Organismus eine bestimmte Codon-Nutzung hat, ist es nun bekannt, dass ein Organism-Gene mehr als ein Codon-Nutzungsmuster haben könnten, und es ist in der Regel nur mit einer multivariaten Analysemethode, die es möglich ist, die Art zu ermitteln der in den Daten enthaltenen Variationen.


GCUA: Allgemeine Codon-Nutzungsanalyse Zugehörige Software