Spindel Workbench. Erwerben Sie ein Verfahren zur Identifizierung von Arten in allen Lebensdauern mit Multiplex-Analyse.
Jetzt downloaden

Spindel Workbench. Ranking & Zusammenfassung

Spindel Workbench. Stichworte

Analyse Reihenfolge Rechenleistung Recheneffizienz Managementplattform Internet-Management-Plattform Rechengeometrie. rechnerisch Rechenmodell Computational Finance Computational Component Computational Biolog. Rechenastronomie Computerchemie Nukleotidsequenz Rechenproblem Rechenleistung rechnerische Neurowissenschaften Rechenansatz. Rechenschaftsgrafik generieren. Rechnerische Intelligenz Azure Platform Management. Projektmanagement

Spindel Workbench. Beschreibung

Die Spindel ist ein alternativer Ansatz zur biologischen Identifikation, der auf der Länge der ribosomalen RNA (RRNA) -Gelegionen basiert. Im Allgemeinen zeigen Ausrichtungen der primären RRNA-Gensequenzen aus verschiedenen Arten abwechselnd Regionen der Nukleotideinsparung und -variante, sowohl in Bezug auf Nukleotidersatz (allgemein als "SNPs") und Insertion / Löschungen (Indel) -Events). Das Vorhandensein von Indels führt zu Sequenzen unterschiedlicher Länge und führt Lücken in die Ausrichtung ein, die typischerweise von einem Bindestrich bezeichnet werden "-". Unser Konzept zur biologischen Identifikation verwendet RRNA-Gensequenzen wie folgt: Konservierte Regionen werden verwendet, um variable Segmente zu definieren ("Spindel Hypervariable-Bereiche"), in denen eine Kombination von Sequenzlängen für jede Spezies charakteristisch ist (ein "Spindel-Profil"). Somit können jede Spezies durch ein eindeutiges numerisches Profil definiert werden. Theoretisch reicht eine Umfrage mit nur 6 hypervariablen Regionen mit jeweils 20 (oder 11 Regionen mit jeweils 11 Regionen mit jeweils 5 Allelen) aus, um alle eukaryotischen Spezies auf der Erde zu diskriminieren, die auf 5 bis 15 Millionen in der Anzahl liegen. In der Praxis kann Spindel 93,3% der eukaryotischen Spezies mit geringer intraspezifischer Variation und hoher phylogenetischer Auflösung unterscheiden.

Spindel Workbench. Zugehörige Software