Snopcgh Ein genomischer Hybridisierungsdaten-Viewer.
Jetzt downloaden

Snopcgh Ranking & Zusammenfassung

Snopcgh Stichworte

Zuschauer Aussicht Daten-Viewer entdecken Meteorologie-Daten-Viewer Multidimensionaler Daten-Viewer Räumlicher Daten-Viewer Genomische Region Methylierung. genomische Methylierung geografischer Daten-Viewer demografischer Daten-Viewer GRIB Data Viewer Modellrechtsdaten-Viewer Genomische Informationen anzeigen. Genomische Informationen analysieren Genomic Information Viewer Genomische Daten anzeigen. Genomischer Daten-Viewer Erkunden Sie genomische Daten experimenteller Datenzuschauer Genomsequenz von Säugetieren Genomischer Simulator genomische Simulation genomisch BAM-Daten-Viewer Phänotyp-Daten-Viewer Zugang genomischen Vielfalt Evolutionärer Daten-Viewer Genomische Datensimulation Genomdaten analysieren Genomische strukturelle Variation Genomic-Loci. Genomischer Annotator Clarion Data Viewer.

Snopcgh Beschreibung

SNOOPCGH ist ein Java-Desktop-Programm, das Sie mit der Visualisierung und Erkundung vergleichender Genom-Hybridisierungsdaten (CGH) unterstützt. Die Software ermöglicht dem Benutzer, mehrere Daten gleichzeitig mehrere Daten zu analysieren. Der Eingang basiert auf einem Tab-, Raum- oder Kommas-getrennten Format, der eine Reihe von Protokollintensitätswerten enthält, die einem oder mehreren Vergleiche oder Proben entsprechen. SNOOPCGH bietet CGH-Grundstücke mit unbegrenzter Zoom (in beiden Achsen), die mit der Maus interaktiv erkundet werden können. Die Verwendung mehrerer Ebenen, die gestapelt und kombiniert werden können, erleichtert die Visualisierung der Daten. Es ist möglich, mehrere Layer an eine Handlung aufzutragen, um die CGH-Verhältnisse zu filtern oder statistische Analysen in interessierenden Regionen durchzuführen. Analyseverfahren wurden implementiert und ermöglichen die schnelle Visualisierung und Dissektion der mutmaßlichen strukturellen Variationen (SVS). Insbesondere werden Daten mit einem Algorithmus basierend auf Haar-Wavelets geglättet, und Inseln potenzieller SVS werden mit SW-Array geschätzt. Wir entfernen Ausreißer vor der Schätzung, um die Robustheit zu erhöhen und die statistischen Signifikanz und der Robustheit der mutmaßlichen SVS mit Permutationen zu schätzen. Diese Quantifizierung putativer SVS führt zu einer Fähigkeit, die interessierenden Regionen einzuordnen. Andere SV-Erkennungsalgorithmen könnten in der Zukunft integriert werden. Eine leistungsstarke Funktion von SNOOPCGH ist die Möglichkeit, mit herunterladbaren Anmerkungsdateien von genomischen Browsern mitzuteilen, darunter Informationen zu den Gennamen und genomischen Funktionen. Der Benutzer hat eine visuelle Darstellung der Anmerkungen am Fuße des Diagramms und kann leicht auf detaillierte Textinformationen zugreifen, indem Sie auf sie oder mit der Textsuche klicken. Direkte Links zu den wichtigsten genomischen Browsern sind integriert.

Snopcgh Zugehörige Software